自四大公投被大張旗鼓搞成政黨對決後，在正方要徹底挫敗反方，反方則充滿危機意識下，雙方的攻防隨之展開，正反的論述也高潮迭起。而民眾需要注意的是，公投案呼籲及贊成投同意票的正方，其實是要否定及改變政府政策的反方，公投案呼籲及贊成投不同意票的反方，反而是肯定及支持政府政策的正方。以下特將正反雙方主要攻防論點按發言順序列出，讓民眾藉此比較雙方高下。
先看藍綠對四大公投案的綜合論點。賴清德等在民進黨南台灣首場宣講強調，四項公投不是總統蔡英文與行政院長蘇貞昌的個人危機，它們真正牽涉的是台灣的危機，人民一定要支持把國家利益放前面、政黨利益放後面的政黨，大家團結為台灣，投下四個不同意。江啓臣等則在國民黨全國巡迴首場宣講說，蔡政府的四個不同意是與人民對決，這場公投就是人民與政府的對決、在野黨與執政黨的對決，呼籲用四個同意換掉政府的不當政策。
上述說法顯示綠營著重的是「台灣危機」及「國家利益」，藍營著重的是「與政府對決」及「換掉政府不當政策」。問題是，主張投四個不同意真的是「政府與人民對決」嗎？這場公投真的是「政府不當政策」逼出來的嗎？
首談「重啓核四」。藍方馬英九強調「核四封存的目的是為了等到適當時機重啓，現在這個時候來到了」；公投領銜人黃士修稱「核四已通過安檢，不需花費太多時間和費用重啓」。綠方則指出，核四是「骨董拼裝車」，重啓不但不可能（當年的廠商已解散、建照已過期、燃料棒也已送回美國），而且核四蓋在地震斷層帶，一旦發生核災，周邊一千萬人口，「台灣一定去一半」。更不必說，十一月十五日朝野六名立委進入核四考察後，直言「裡面問題密密麻麻」「設計確實有問題」；連台電都表示核四不安全（一號機運轉安檢未通過，二號機施工未完成），原能會也指核四「依法嚴格而言已非核電廠」。
次談「反萊豬」。藍方一直說萊豬有食安問題，是毒豬；馬英九、蔣萬安等又說台灣人對美豬的消費超過美牛很多倍；而美國不是CPTPP成員國，推動萊猪公投與台灣無法加入CPTPP無關；何況中國與歐盟都禁萊豬，台灣人不該當次等公民（註：世界首強的美國國民都吃萊豬，難道他們是㳄等公民？）。關於食安，全世界吃萊豬從無食安問題，聯合國國際食品法典委員會已有太多科學數據為證，這點毋庸再論。且看其他幾點綠方如何回應：
農委會主委陳吉仲引用正確數字，指出台灣每人每年平均消費美牛2.7公斤，是平均消費美豬的四倍，而且美豬只有不到兩成使用萊劑，美牛使用萊劑比例卻為美豬三倍以上，國人吃到萊牛的機率遠高於萊豬。參與中選會電視發表會的李淳也說，歐盟因禁萊豬，已連續十五年讓美國取得一億美金報復授權，中國去年更已和美國達成協議，將加速萊豬開放。他並說，反萊豬公投若通過，就代表台灣已承諾之事還要毀諾，會使倚賴貿易的台灣大受傷害。
