到3月13日逮捕到更多的人,又補送一份較詳細的名單,也加上莫須有的罪名。陳儀在3月13日的信上同時向蔣介石請示:「台灣因非接戰區域,不能援用軍法。普通司法寬大緩慢,不足以懲巨兇,奸黨因得肆無忌憚。⋯⋯司法手續緩慢,而台灣情況特殊,擬請暫時適用軍法,使得嚴懲奸黨分子,以滅亂源。」〔1〕當時蔣介石並沒有回應,顯然留給即將來台灣的白崇禧國防部長處置。
國民黨台灣省黨部主任委員李翼中在3月4日約見蔣渭川,跟他說:「為今之計,惟有籲請中央,然後臨之以威、綏之以德,自可速平,而免糜爛。」這種說法顯然與蔣介石的做法相符合。蔣介石在二二八發生後,立即在3月3日命令江蘇崑山的駐軍開赴台灣及於3月5日派二十一師來台灣。蔣介石詳細地指導陳儀如何佈置軍隊及要求1天須呈送3次的軍情報告。3月8日及9日連續2天蔣介石更召見二十一師長劉雨卿,親自指示如何殺台灣人,更要劉雨卿當日飛台灣,轉告陳儀「面詳一切」的秘密指令。〔3〕
蔣介石預知會殺死很多台灣人,在3月8日間就已指派白崇禧,在大屠殺後來台灣宣慰。擔任國防部長的白崇禧派遣軍隊來台灣、調動軍艦接送、安排彈藥及補給等工作。忙得差不多以後,白崇禧於3月17日來到台灣,當晚白崇禧的廣播一開始就說:「奉蔣主席的命令宣慰台灣,對此次遇難同胞,代表宣慰。」白崇禧扮演了很好的宣慰角色,在報紙及演講說了很多安慰台胞的話,免去幾個市民及年輕人的罪行,也要求軍隊不可再亂來,都只是為了安定人心,避免事件擴大。
骨子裡,國防部長白崇禧主要是來視察軍隊的運作及加強對台灣人的追殺,而同來台灣的蔣經國則來當蔣介石的耳目。蔣經國抵台隔天3月18日立即拍發電報給蔣介石:「親美派—林茂生、廖文毅與副領事Kerr(葛超智),請美供給槍枝及Money(金錢),美允Money。」誣告台大文學院長林茂生及廖文毅向美國人要求武器和金錢。〔4〕
白崇禧於3月24日也呈報蔣介石:「正待加緊追繳清剿。一切善後尙須審慎處理。正巡行各地,詳加調查研究中。對台事決定,最好待職宣慰工作整個完成,報請鈞裁,較為適當。」及「國內台籍各團體人民代表僅憑風說提出種種要求,尚懇鈞座勿輕許諾。」〔1〕足證白崇禧表面在宣慰,真正在督導二十一師的軍隊來鎮壓及清剿台灣人。白崇禧來台灣之前,在南京已經接見很多位台灣旅滬人士,聽到他們的哀求,他們也以為可以信任白崇禧。〔5〕他們怎能料到白崇禧在背後要求蔣介石,不要聽從台灣人的呼籲?足證白崇禧很會欺瞞台灣人,他一方面扮演白臉,另一方面也黑心扮演黑臉。