台灣18日舉行的公民投票受到日媒高度關注，包括《每日新聞》與共同社都強調，尤其「反萊豬」公投的結果可能影響日漸緊密的美台關係。《產經新聞》與《每日新聞》則指出，這次台灣公投對日台關係也會造成影響，因為美國進口的豬肉要是被擋，恐怕福島等地食品輸台的解禁時程會再延後。《朝日新聞》更明白指出，既然這次四大公投盡墨，福島食品輸台解禁已露出曙光，以便台灣加入《跨太平洋夥伴全面進步協定》（CPTPP）。
在這次的四大公投之中，日媒特別聚焦在「反萊豬進口公投」。《每日新聞》指出，重視台美關係的蔡英文政府在今年1月正式解除含萊克多巴胺豬肉的進口禁令，引發在野的國民黨提案反對，並且在收集必要的簽名連署後要求舉行公投。《每日新聞》強調，食安問題在台灣極受重視，這次公投成案後民調也顯示支持禁止輸入萊豬的意見一直保持上風，不過蔡政府還是強烈呼籲解禁，並且強調對台美關係至關重要。
《每日新聞》引用我國行政院統計資料，表示從今年1月解禁後到12月16日為止，美國進口台灣的豬肉約有1779噸，大概是進口豬肉總量的3%。不過日媒關心萊豬進口的原因，主要還是在於台灣在2011年福島核災後立即禁止福島、茨城、櫪木、群馬、千葉生產的食品進口，至今未能解禁。日方雖然一直強烈要求取消禁令，但台灣在2018年曾通過「反核食公投」，如果這次「反萊豬公投」過關，恐怕對於開放日本五縣食品的時程又會有所拖延。
由於「反萊豬進口公投」除了根本未過表決門檻，不同意票也超過了同意票。《朝日新聞》18日晚間指出，台灣選民顯然更為支持蔡英文政府的外交經貿政策，認為食品安全在萊豬議題「是另一回事」。《朝日》也提到2018年的「反核食公投」，不過在「反萊豬進口公投」功虧一簣之後，《朝日》認為蔡英文政府將積極規劃恢復日本食品進口，以便台灣加入CPTPP。
共同社則指出，除了反萊豬公投之外，包括「核四商轉」公投、「公投綁大選」公投、「珍愛藻礁」公投，對於台灣的外交、經濟、能源政策都有重大影響，更會對明年台灣的地方選舉以及2024年的總統大選造成衝擊。《每日新聞》強調，台灣這次公投全部都是由國民黨主導，民進黨對其全部加以反對，因此要是四大公投過關，將會對蔡英文政權造成極大阻礙；《朝日新聞》則說，這次公投形同蔡英文政府通過了不信任投票的考驗。
