立院財政委員會昨天審查《會計法》第99條之1修正草案，由於此案攸關國務機要費修法，被認為是為前總統陳水扁除罪。民進黨立委以人數優勢表決，將草案送出委員會交朝野協商、宣布散會。國民黨團22日上午召開記者會指，據傳監察院長陳菊對此案修法「關切」，希望民進黨團成員力挺。國民黨團譴責陳菊糟蹋監察院長官箴，對監委做了最壞示範。國民黨團質疑，此事監察院本身會調查嗎？並呼籲違反過去承諾的陳菊應知所進退。
針對媒體指「陳菊介入立院會計法修法」一事，陳菊辦公室22日下午近3時發布聲明表示，一、陳菊向來恪遵憲法分際，秉持院際之間相互尊重，對於立法院依據憲法規定為最高立法機關，有議決法律案等權，不曾亦不可能干涉，更絕無外界指稱關切或交辦等情；二、相關報導純屬空穴來風，與事實不符，至感遺憾，並盼外界理性討論。
總召曾銘宗表示，據媒體披露，昨天民進黨財政委員會召委會排審《會計法》修法前，陳菊居然打電話給相關立委，但陳菊不該涉入扁案。
曾銘宗進一步指出，《憲法增修條文》第7條規定，「監察委員須超出黨派以外，依據法律獨立行使職權。」陳菊現在是新潮流大老、高雄市長、還是總統府秘書長？曾銘宗批評，身為監察院長公然介入扁案，根本德不配位。曾稱，國民黨團還掌握到陳菊建立監委Line群組「交換意見」，已經違反了《憲法增修條文》第7條的規定。曾表示，陳菊根本就不合適再擔任監察院長，葬送監察院的公信力。
首席副書記長李德維表示，國務機要費除罪化，本質就是掩護貪腐，前總統陳水扁「海角7億」還是70億沒有人知道，但在民進黨立院黨團總召柯建銘指揮下，多數暴力強行修《會計法》第99條之1，將國務機要費除罪化，為貪污護航還能夠獲得人民信任嗎？
李德維質問陳菊，為何介入國務機要費除罪化的修法，是過去陳水扁擔任總統期間拿了很多不該拿的錢嗎？2006年陳菊競選高雄市長時，陳水扁給了妳多少錢？是不是陳菊曾經拿過陳水扁相關貪污的錢，所以投桃報李、出面關說？
副書記長陳以信表示，監察院長也是監委之一，陳菊竟然未能超越黨派令人遺憾。陳以信指出，陳菊過去在就任監察院長前曾說，「監察院長必須超出黨派，本身會退出民進黨。」但陳菊涉入陳水扁國務機要費的黨派立場、修法立場，逾越了監察院長該有的職權，須向國人道歉。
陳以信表示，陳菊擔任監察院長後又說「時間會證明一切」，證明她是會超越黨派的監察院長；但扁案的國務機要費，證明陳菊沒有超越黨派，證明她是民進黨的監察院長，陳菊涉入黨派之爭，須向國人鄭重道歉，審慎思考，負起政治責任。
