談到天主教香港教區發新聞稿回應，香港《明報》報導，有天主教徒透露，天主教香港教區主教周守仁前晚在其Facebook上發文，表示：「『反應』往往會造成傷害，大家需要時間和空間作出『回應』」，但周並無說明以上所指的是甚麼事。在回應聲明之前，澳門教區有轉發梵蒂岡訊息，香港教區的「公教報」、「公教頻道」兩個天主教香港教區的Facebook專頁，並無發文提及陳日君被捕。顯示港澳兩教區皆採取低調來因應此事。（台灣教區也沒有報導與反應，只有國內媒體報導了此事）
倒是目前擔任「亞洲主教團協會」主席的緬甸薄茂恩（Charles Maung Bo）樞機主教站出來發聲，他在5/14日向美國天主教媒體「每日羅盤報」（The Daily Compass）投書，呼籲全世界天主教徒在5/24為香港祈禱，特別是為陳日君祈禱。
薄茂恩指出，香港曾經是亞洲最自由、開放城市，如今已變成一個警察國家，言論自由、新聞自由、集會結社自由、學術自由都被剝奪，宗教信仰自由也有備受威脅跡象；最近香港的親北京媒體不斷對教會進行文宣攻擊，導致宗教領袖必須更多自我審查。
薄樞機表示，看到一座城市從昔日的自由燈塔，如此激進快速地走上一條黑暗、受壓迫的道路，令人心碎；看到中國政府如此明目張膽違背在國際條約中對香港作出的承諾，令人震驚。
他更質疑：612基金是為面臨訴訟的民運分子提供法律援助。在任何法治尚存的體系，協助面臨訴訟者支付法律費用是一項適當且公認的權利，幫助被告進行法律辯護和代理，陳日君樞機擔任基金受託人，「怎麼可能構成犯罪？」
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對比緬甸薄樞機和教廷的反應，國務卿帕羅林樞機表示對陳樞機的處遇「深感遺憾」，同時對陳樞機在警方偵訊後獲一保釋而表達他的關懷。不過對於整件事顯然避而不提，顯然是外交上的考量採取低調處理，以免造成北京的誤會。更進一步當記者提到此事會不會影響中梵臨時主教協議？帕羅林樞機認為，這個事件不應被看作是對聖座與中華人民共和國關於主教任命協議的「否定」。陳日君樞機是非常反對教廷與北京之間這項臨時協議，他曾表示不明白教宗怎麼會准許「邪惡的事」，認為中共是利用梵蒂岡消滅地下教會，協議是為中梵建交舖路。陳樞機認為這對大陸地下教會的神職人員與教友是不公平與不公義的。
這項協議於2018年簽署，去年中梵雙方同意再延續了兩年。帕羅林樞機顯然有點擔心在這個敏感事件與敏感時期，不要讓陳樞機的事再發展下去或惡化下去。所以他會向記者表示，「最實際的祝願是，這樣的事件不使已經複雜且不易的對話行程更加複雜」。因為從教宗方濟各對於中國教區的基本立場，有對話總是好的開始，與北京保持對話總是好事。帕羅林樞機正是教宗這個立場的具體執行者。自然不會希望，陳日君樞機事件會影響中梵下一步的發展。
