另外，針對原權團體長期以來批評政府，為踐行《原基法》第20條，成立「原住民族土地調查及處理委員會」，《原權條例》立法後，也將確實履行《原基法》第20條規定，明定政府應當設置獨立機關「原住民族歷史正義及土地調查委員會」，對民住民族遭佔用之土地進行調查。未來原調會的人員編制，將比照促轉會與黨產會，排除《中央行政機關組織基準法》之適用。
原調會有準司法調查權
根據《原權條例》草案之說明，未來原調會所調查之原住民族迫害事件，將包括日治時期所實施集團移住，將原有數個部落集中式管理，國民政府時期為推行山地行政之便，所實施之遷村。透過集團移住、禁止設置傳統領袖、剝奪傳統領袖地位、禁止設置傳統組織等方式，破壞原有部落傳統權力結構。日治時期皇民化運動或國民政府時期，所推行語言同化政策，未來也將進行調查。
在原住民固有領域部份，台灣開墾史當中，漢族移民透過武裝集團侵墾，迫使原住民族放棄原有之土地，或日治時期透過相應之法令，使原住民族喪失對其土地之使用權利，以及國民政府時期為相關土地政策等等，使原住民族土地流失加劇，未來也將會處理。
夷將表示，攸關原住民族傳統領域回復的《原住民族土地及海域法》，過去送立法院審查，之所以遲遲無法通過，主要關鍵原因，在於原住民族固有領域土地，始終未完成調查。《原權條例》通過之前，總統府已在前年底成立原住民族促進轉型正義委員會，「原住民族的促轉，比促轉會還要早一年半，目前也在運作當中」，未來《原權條例》通過後，原調會比照促轉會有準司法調查權，未來在原住民族固有領域之土地調查，將更有公權力。
