另依照新北市政府國家賠償事件處理要點第十一條規定：「各機關就請求權人於國家賠償法所定二年時效內提出請求，而逾二年時效後始拒絕賠償之事件，應於拒絕賠償理由書上載明：『請求權人如不服拒絕賠償之決定，請於六個月內向普通法院起訴，逾期本機關依法得主張時效抗辯』。」查其他各縣市亦有相關規定，故相關案件之被害人如欲主張權利，首要應於兩年內向賠償義務機關提出書面請求，如不慎逾期，尚有半年時間得起訴救濟。（然各縣市未盡相同，被害人仍須注意相關規定）
總歸一句，時效消滅，係指對方可以拒絕給付，但如果對方仍願意賠償或返還，則不受此限制。至於在何等狀況，政府會願意在時效消滅後仍願意進行國家賠償，筆者無法預料。
二、書面協議先行程序
據報載，新北市法制局長吳宗憲表示：「目前市府內仍有多起國賠案件仍在審理當中，如果恩恩爸國賠案掛號入案進來新北市府辦理的過程仍需要排隊，但難免又引起外界揣測是否有故意拖延，因此屆時也會請評委們開會討論，是否能讓此起社會矚目案件優先審理」吳局長另也提醒：「另一點則是恩恩爸此次國賠訴訟是針對『行政機關』提出，還是直接向法院提起的民事訴訟，訴訟方式不同，要審理的機關也會不同。吳強調，如果是新北市府該受理的行政訴訟，他百分之百沒問題，一定會受理。」吳局長的話單獨條列並無問題，但在細節上似有可以解釋更清楚之處，分析如下：
國家賠償法採雙軌制進行，一者是行政訴訟(依行政訴訟法第7條規定：「提起行政訴訟，得於同一程序中，合併請求損害賠償或其他財產上給付。」得合併申請國賠)，一者是民事訴訟，則需採書面協議先行程序(依國家賠償法第10條規定：「依本法請求損害賠償時，應先以書面向賠償義務機關請求之。賠償義務機關對於前項請求，應即與請求權人協議。協議成立時，應作成協議書，該項協議書得為執行名義。」。(民眾若想閱讀、了解更多國家賠償重要注意事項，可參考法律扶助基金會所製作之說明文件：搞懂國家賠償。)
最高行政法院93年判字第494號判例意旨參照：「人民因國家之行政處分而受有損害，請求損害賠償時，現行法制，得依國家賠償法規定向民事法院訴請賠償外，亦得依行政訴訟法第7條規定，於提起其他行政訴訟時合併請求。二者為不同之救濟途徑，各有其程序規定。人民若選擇依國家賠償法請求損害賠償時，應依國家賠償法規定程序為之。若選擇依行政訴訟法第7條規定請求損害賠償時，自僅依行政訴訟法規定程序辦理即可。行政訴訟法既未規定依該法第7條規定合併請求損害賠償時，應準用國家賠償法規定，自無須踐行國家賠償法第10條規定以書面向賠償義務機關請求賠償及協議之程序。」
