林智堅說明第5點，2月1日這個檔案之所以至為關鍵，是因為余正煌的研究計畫是在之後的3月才完成並通過口試。試問在當年1至2月寫作出這些文字的時候，如何有辦法抄襲余正煌後來才完成的研究計畫或論文？必須說明，在此時林智堅和余正煌並不認識、也無互動，更沒有人將余正煌寫作過程中的任何資料提供給林智堅參考。
林智堅解釋第6點，同樣的，余正煌7月完成論文畢業，但林智堅早在該年5月18日就申請研究計畫口試、5月24日通過。林智堅參考余正煌論文，是在他畢業之後一陣子的事，記憶中取得的時間約在該年11月左右，並參考了余正煌結論部分的架構，為此林智堅也將余正煌的論文列入參考書目當中。林智堅之所以未能在這個階段發現余正煌論文中研究設計的部分與林智堅的文字有高度雷同，是因為這個部分林智堅早在2016年初就完成寫作，並經過陳明通的指導修正，所以沒有必要去參考余正煌的論文，以致沒能發現。
為何部分論文高度雷同？林智堅：請台大參考陳明通的說法及聲明
林智堅聲明強調，以上所陳述的事實，可以說明沒有抄襲余正煌的論文。至於為何2人研究設計的寫作有高度雷同，林智堅的說明僅能就自己的部分自證清白；亦請學倫委員會的先進參考陳明通的公開說法及聲明。
林智堅於聲明結語提到，自己今年47歲，從事公共事務服務22年，幾乎占了他人生的一半，他帶著熱情、理想，並且充滿熱忱對待每一個人，在7年半前有幸被新竹市民肯定，成為新竹市長，但他仍然不放棄學習的機會，想要透過台大國家發展研究所的課程，以及老師的指導，精進他在政治這領域上的能力以及視野，同時身為一位被外界稱為年輕世代的縣市首長，他比任何人更在乎自己的人格和名譽。
林智堅表示，藉由以上的說明，竭盡所能地去還原當年碩士論文寫作的真相。其中屬於他自己的部分，受限於幾年前個人電腦曾經更換以至於部分論文寫作資料遺失、以及就學時期使用的台大電子信箱內容已被台大計算機中心刪除，故可能無法更為周全，但他已盡一切可能去搜集資料與證據。余正煌的部分除了間接獲得資訊以及論文的比對外，更需要台灣大學學術倫理審定委員會的協助查明，並做出符合事實真相的客觀判斷。
