蔡詩萍指出，因為論文抄襲並非隨便指控就能成案的。論文抄襲已有非常客觀檢測的工具，也有學界一般判定的準則，只要按部就班，只要加以核對比較，答案不會不水落石出的！他也質疑，難道綠色學者就會「指鹿為馬」，藍色學者就會「馮馬不分」嗎？個別情況不是不可能，但若是一個委員會集體決議就很難。何況，這幾篇論文早就成為公共資產了，有興趣的外人，可以自行下載比對，請問哪位藍綠學者敢公然說謊，敢冒天下之大不諱呢？
因此，蔡詩萍批評陳明通、林智堅師徒若非想太多，便是政治思維凌駕一切，但都是「小看了台大」！而民進黨內其他的台大人，可以這樣小看台大嗎？過去從黨外到民進黨，獲得了多少台大人支持？只因為台大人從知識真理上，知道民主、開放社會的價值，知道批評精神的可貴。而今，民進黨已貴為執政黨，甚至2度執政中央，且2位民進黨總統都是台大人，要說不知道台大的精神、台大的傳統，我不但不信，甚且認為那是對2位總統曾是台大人的一種羞辱！
論文門有「政學交易」嫌疑 蔡詩萍：期待綠營台大人表態
蔡詩萍提到，台大人如果過去可以反對國民黨，支持民進黨那叫台大精神的發揮，那如今質疑民進黨，支持其它政黨，難道就叫開倒車嗎？就叫會在學術審查時，不公正嗎？這是民進黨在林智堅「論文門」上，犯的第一個傲慢：不尊重台大精神。其次，民進黨也輕忽了台大人對知識的尊敬。台大人有一定有程度的「不識時務」，乃因他們在世俗價值中，往往會選擇從事學術工作、從事知識的鑽研，因為這是台大人的傳統，喜歡讀書、喜歡不那麼功利的探求真理。
而現在爆發「論文門」，台大學位有輕易被「政學交易」的嫌疑，蔡詩萍表示，台大人怎麼不生氣？應該不生氣嗎？更糟的是，林智堅團隊，根本不願意相信、尊重台大對知識在乎的程度。那麼多民進黨人曾在台大唸書、教書，難道他們也同意林智堅團隊，對台大的質疑與羞辱嗎？那麼多民進黨從政者去台大進修，難道他們要的只是學位，不是成為台大人一分子的台大精神嗎？
蔡詩萍補充，光看幾位民選總統出身台大黨派不同，就該知道台大精神的包容度了。而政黨政治裡每個人難免有政黨選擇，但在民主開放社會中，我們不該以此來否定其專業與價值，否則就是「非我族類的黨天下」意識，過去民眾為何反對國民黨威權？不就因為它黨天下嗎？民進黨如果全黨救一人，救到沒是非，救到與「台大精神」為敵，甚至污衊台大精神，那它就已經在往黨天下沉淪了，並表示自己很期待民進黨內的台大人出來表態。
