漁業署補助1667萬元 箔子寮漁港清疏
不過，雲林縣政府對於該案仍不死心，從水利署轉到了農委會漁業署。據了解，由於年底選舉在即，漁業署最後同意補助雲林縣政府二筆預算，分別是「萡子寮漁港外砂洲地形變化」監測計畫經費500萬元，以及箔子寮漁港清疏預算1,667萬元。
根據《中央社》報導，雲林縣政府水利處長許宏博表示，箔子寮漁港是目前評估縣內最適合設立離岸風場維運碼頭的港口，雲林縣政府向漁業署爭取清疏淤積泥沙及港外沙洲地形變化監測經費，「可望克服港口水深不足問題。」
但根據熟悉內情人士表示，箔子寮原本是雲林最大港口，但是過去十幾年來因為雲林外海的砂源不足，箔子寮港外海的沙洲，正面臨外側侵蝕、往內陸加速靠岸的情況，箔子寮港因為淤積嚴重，目前只能讓膠筏進出，如果要建設為風電維運碼頭，不僅港區要濬深超過3公尺，外海還得要挖出一條水道，「整體建設費用，絕對不僅僅只是雲林縣政府爭取的2億元。」
被要求為箔子寮漁港清疏預算埋單的漁業署，同樣也覺得委屈，一位不具名官員表示，行政院工程會先前才要求漁業署，針對全省使用率偏低的漁港進行全面檢討，箔子寮漁港屬於「第二類漁港」，主管機關為雲林縣政府，目前台灣西部沿海漁港，都有淤積問題，農委會補助箔子寮漁港清淤，和箔子寮爭取前瞻基礎建設「水環境建設」，升格為風電維運碼頭，二件事情不該混為一談。
對於各縣市政府爭取將境內漁港，轉型為「風電維運碼頭」，漁業署官員表示，中部地區可以提供風電業者承租的碼頭，其實已經不少，包括台中港、彰化漁港、麥寮工業港，甚至可以選擇台北港或高雄興達港等。
如同維傷電線桿 建立停車場
官員強調，不是每一家風電業者，都該有一座專屬的維運碼頭，「畢竟離岸風機，就像陸上的電線桿一樣，平常不是都需要進行維修，800架離岸風機不會每天都壞掉，你有聽過台電為了要維修電線桿，要興建專屬的停車場嗎？」
