柯建銘和柯文哲捲入「三億男事件」，名嘴連日口水齊發，輿論風向也一面倒向指責柯建銘。15日民進黨正式提名蔡英文的中執會，蔡在執政縣市長和中執委的簇擁下正式成為黨參選人，而柯建銘低調不出席，就是為避免焦點被模糊。
其實，13日柯文哲赴北院替周玉蔻作證、讓柯建銘不得不出面召開記者會公開「3億捐給世博台北館」，當天柯建銘臉書便遭到網友砲火圍剿，親綠媒體也對他不客氣，隔天柯建銘就沒有出現在台北，僅透過辦公室發出聲明。
不過15日在民進黨中央，有不少綠營人士私下為柯建銘抱屈，中執委林俊憲聊到這件事時，就認為此事是老柯（柯建銘）委屈地幫柯P承擔。一位中執委則抱怨，明明是柯文哲拜託柯建銘求見郭台銘，但卻有些網友十分不理性地把事情講成老柯找郭要脅柯P，私下認為柯P此事應該給柯建銘交代。
另位黨內幹部私下也說，實在想幫柯建銘說句話，黨內都知道柯建銘在柯P選戰期間承擔許多事，從在野整合、立法院協助處理無黨候選人監票等爭議，柯建銘都居中協調，這些事情柯P支持者並不一定瞭解，若替柯建銘說些公道話，又擔心柯P支持者不理性，指責民進黨維護自己人、修理柯文哲，讓黨內有意說話者左右為難。
鄭運鵬與綠委劉櫂豪、李應元等人近日在政論節目替雙柯說話，鄭直說柯建銘是「公親變事主，又好心沒好報」，柯文哲應道歉。
李應元身為柯文哲競選時的黨政平台秘書長，理解當初柯競選團隊求見郭台銘的前因後果，替柯建銘澄清事情過程，委婉指出「雙柯講話都不清楚」、「柯文哲誤解柯建銘的談話脈絡」，即使為柯建銘遭到輿論及媒體圍剿抱不平，但也延續柯建銘「護柯P」的論調。
李應元也說，柯文哲當時在選前計畫拜訪包括企業家在內的各階級人士，希望郭台銘等大老闆能支持柯的青年創業政策，因此找上柯建銘協助。柯建銘當時分析郭台銘長期以來一直支持國民黨，從力挺九二共識到積極替藍營人士站台，其中包括3億援助世博台北館一事，勸柯文哲打消念頭。李說，因此這個話題純粹是誤解所產生的烏龍，可以理解柯文哲很挺周玉蔻因此出庭作證，而柯建銘也很挺柯文哲因此一直未公開指正他，雙柯都沒有惡意。
