針對委員、學者專家提出的憂慮，除國科會表示已進行相關研議，並將審慎告知學者進行研究時做好適法性利用。中研院則表示，過去5年中研院建立台灣最大的基因資料庫，搜集50萬人的基因資料，以及臨床資料，盼未來能精準預測如糖尿病、乳癌等疾病發生率，早期預防也節省健保經費。而搜集的基因資料，所有機台皆為美國機台。
衛福部食藥署及醫事司則表示，研究使用的機台和納入醫療器材的機台不同，根據特管法送交的報告、計畫等，並未看到有華大公司的機台。經濟部工業局和技術處則表示，將繼續扶植台灣產業，也都針對計畫申請審查是否有中資企業介入，認為應無基因外流疑慮。
不滿官方回應 林岱樺籲盡速修法彌補漏洞
對於政府單位的回應，林岱樺批評，包括中國附醫、長庚大學、台中榮總等，都有設置華大基因的檢測機台進行相關研究，衛福部甚至還讓華大基因次世代定序機台取得LDTs認證，向台灣民眾提供相關基因檢測服務，當中的漏洞、以及是否有透過間接方式取得認證，有必要進一步徹查。
林岱樺表示，「國家安全法」修正草案去年5月三讀通過，防止國家核心關鍵技術的營業秘密外洩他國。今年2月國家資通安全研究院也正式成立，代表政府強化資訊安全的決心。但在現有架構下，仍欠缺單一的專責機關來評估是否渉及國家重大利益。此外，包括「個人資料保護法」、「人體生物資料庫（Biobank）管理條例」等的評估制度也需要更加完善。
林岱樺呼籲，台灣政府應儘速撤查中國基因檢測機台在國內使用狀況，並對於生物檢體外送或生物資訊相關的法案，應該要有專責機關統籌，儘速完成修法，同時研擬基因定序出口管制，透過法規及政策的調整，讓基因定序技術能安全用於臨床上，實現促進精準醫療的目標。
