前國安會秘書長蘇起最近在新書《美中對抗下的台灣選擇》裡提及，前陸委會主委賴幸媛任內領導的陸委會潛伏了類似美國的「深層政府」，延續前總統李登輝「兩國論小組」的思維與政策，並重用陸委會副主委詹志宏、國安會諮詢委員傅棟成2個核心。對此，賴幸媛接受《風傳媒》專訪時表示，蘇起學舌美國前總統川普（Donald Trump）使用deep state（深層政府）的語言，這樣的指控不淪不類到極點，張飛打岳飛，荒謬到她只能說「啼笑皆非」。
賴幸媛則高度肯定詹志宏和傅棟成都是國家文官體系培養出來非常優秀的幹才。賴幸媛指出，她帶領下的陸委會團隊，執行的就是馬總統的「以台灣為主，對人民有利」的大陸政策綱領，「當過1年9個月的國安頭子，若連基本情資蒐集的能力都有問題，連基本事實都錯得離譜，他（蘇起）會被馬總統拔官，也就不意外了。或許因此耿耿於懷，就長年不斷砲打過去重用過他的長官？太不厚道。」
