台中捷運工程發生鋼箱梁掉落意外，據媒體報導，中捷包商大陸工程有意向代辦工程的北市府求償2億，更有台北市捷運局公務員因此遭起訴；北捷局身為北市府下轄單位，卻主管其他縣市工程的奇特現象因此躍上檯面。
事實上，北捷局的定位一直相當吊詭，許多不合理的現象也存在已久，例如：新北市新莊、蘆洲捷運支線的工程，北市府代墊省府時期積欠的100億款項，但新北市府與中央均不同意撥款支應，導致至今仍由台北市民的市庫出資。
北捷局吸納了台灣交通工程方面的實務精英，大台北捷運路網興建初期，曾有過88公里一起動工的黑暗時期，從那時候開始，就累積了大量的經驗，當然也包括用生命換來的「血的教訓」。正因為台北捷運工程局擁有豐富的捷運規劃、設計、監造等經驗，當各縣市要興建捷運時，自然會找上北捷局代辦。
除了台北市內的捷運路段由北捷監造，新北市長朱立倫喊出的新北捷運三環三線、台中捷運全段工程、桃園捷運部分路段等，也都由台北捷運局代辦管理，並加收1%到4%的工程管理費，形成北市府的下轄單位管其他縣市工程的特殊現象。
其實，早在1986年北捷局成立初期就討論過這些問題，但當時交通部並未出面統合成一個單位負責，最後仍由北市府成立北捷局專責、行政院經建會成立協調委員會，協調各方意見，才造成北捷局今日的困窘局面。
北捷局遇到的問題還不只如此。根據市府工管處資料，截至今年6月為止，北捷局代辦工程項目龐雜的超乎想像，例如多段路面更新工程、市場改建，還有新建兒童樂園、校舍改建等與捷運無關的工程都一手包，洋洋灑灑總共126項，不禁讓人質疑，是否因為台北捷運路網已接近完成，所以必須代辦這些工程才能養活局內的1404名員工？
對此，捷運局長周禮良解釋，工務局新工處承接其他單位如文化局、體育局、市場處等的工程，若無暇顧及，就轉分工到北捷局身上；捷運局每年仍有300億的捷運工程正在進行，包括萬大線、信義東延段等，還要承接新工處的工程讓他們相當吃緊，而且這些工程雖有收取工管費，但幾乎都是賠錢在做。
除此之外，困擾北捷局的還包括「傳承」問題。北捷局當年成立時，吸納一群正值壯年的設計規劃工程師，至今已有40%屆齡退休，周禮良擔心，這些經驗豐富的國內捷運工程專業人才恐將面臨嚴重的斷層危機。
