全台各地捷運工程接二連三啟動，台北市長柯文哲曾建議中央單位出面統合成立「捷運工程總局」，交通部卻表示近期無此規劃；之後，柯文哲迄今未向中央表達協調之意，交通部則以「你不動、我不動」的態度回應，成立「捷運工程總局」看來遙遙無期。
台北市捷運局長周禮良表示，交通部之前曾努力想要統籌建立「捷運工程總局」，但後來因故放棄，現在中央政府組織改造已近尾聲，他理解這個時候不會再有大動作的變革，但北市府是為了全國著想，才提出由交通部統籌的想法。
由於台北捷運局接受委託代辦的中捷發生意外，台北捷運局恐將被追討鉅額賠款，未來若發生類似事件，北捷局對於責任歸屬是否已有因應對策？周禮良只回應說，「不要再發生意外，目前就照這個來走，要大改變不太可能」。周禮良的回答正表現出其對此事的悲觀，只能被動祈求別再發生如中捷般的工程意外。
交通部路政司副司長王穆衡則對此回應表示，現階段正進行組織改造，但組改過程中，並未討論新增統籌全國捷運工程的單位，囿於《行政院組織法》的相關規定，變革後的組織數量已達法定額度，不可能再增加一個「捷運工程總局」。此外，他也表示，北捷方面並未向交通部提出書面或口頭要求。由交通部的說法來看，近期北捷還是會繼續承接其他縣市的捷運工程。
不過，王穆衡也補充，目前各縣市已成立高雄市捷運工程局、新北市捷運工程處等捷運相關單位，陸續進行捷運工程，只不過北捷局依然擁有最豐富的人力與工程管理經驗，台中市因考量到尚無條件成立捷運局，才行政委託給北捷代辦。
對於中捷意外，北捷恐付出巨額賠款，王穆衡則表示，北捷當初同意其他縣市的行政委託時，應衡量過風險與得失，也收取工管費，中捷出事，監工的北捷理當負起應負的責任。換句話說，交通部認為，依據市場機制，這是北捷應負起的責任，不應逃避。
