「醫師無法阻止種族屠殺」
而有時他們也會遭遇當地政府的阻撓，1984年無國界醫生在衣索比亞進行營養治療，翌年他們譴責衣索比亞政府濫用援助並強迫百萬平民遷徙，因此被當局勒令終止救援，被迫撤離。
值得注意的是，無國界醫生並非反戰組織，而是獨立的國際醫療人道救援組織。1994年盧安達種族屠殺發生時，由於死傷太過慘重，就連許多當地的工作人員也遭到殺害，因此該組織首次公開呼籲國際間的軍事介入，因為「醫生不能制止種族屠殺」（Doctors can’t stop genocide.）。
獲諾貝爾和平獎 獎金助「病者有其藥」
1999年無國界醫生獲頒諾貝爾和平獎，多年來援助災區人民的努力受到國際肯定。而他們也將得到的100萬美元獎金（新台幣3000萬元）用來推行「病者有其藥」運動。當時每年有數以百萬的病人買不起藥物，死於原本有藥可醫的傳染病。此運動為那些貧窮的病人，提供一線生機。
MSF機動性高 第一時間調派人力
哪裡有災情，無國界醫生就會想盡辦法前往救援。近年來較嚴重的災情，例如南蘇丹難民危機、敘利亞武裝衝突、西非伊波拉病毒大流行，甚至是前兩個月發生的尼泊爾大地震，都可以看到他們的身影。
然而前線救援任務不僅艱辛，有時甚至相當危險。2011年10月，無國界醫生救援人員塞拉（Montserrat Serra）和蒂埃博（Blanca Thiebaut）在肯亞難民營被擄走，歷時2年才被釋放。
救援志工要冒生命危險
同年還有兩名救援志工，在索馬利亞進行救援行動時遭槍殺。後來因為衝突日益嚴重，以及有關當局的縱容，因此無國界醫生決定結束在當地長達22年的所有救援行動。
2014年1月，有5名工作人員遭恐怖組織「伊斯蘭國」（IS）綁架，雖然後來獲釋，不過這情況也迫使無國界醫生從伊斯蘭國控制區撤離。每一項前線救援任務，都得經過審慎的安全評估才能通過，藉以保障工作人員的人身安全。
