以上三個事件導致，獨立時的敘利亞看似是民族國家，實則是多族群的集合體，且各族關係相當緊張：德魯茲人、庫德族、阿拉維派都是少數，卻在法國統治下受到重用；遜尼派阿拉伯人作為背靠英國的主體族群，則因此對前者心懷不滿。簡單來說，敘利亞呈現許多全球南方國家的共有慣性：國家疆域由殖民者劃定、國內族際關係由殖民者一手塑造，各大族群互有民族主義，卻缺乏國家層級的統一認同。
而這種裂痕經歷多次政權流轉，始終沒能彌合。1946年至1956年間，敘利亞歷經20個內閣、4部憲法，軍人政變逐漸取代文人政權，同時又受以阿戰爭、蘇伊士運河危機影響，浸潤在納瑟主義、泛阿拉伯主義和反帝國主義思想的時代狂潮中，並一度在1958年與埃及合併為阿拉伯聯合共和國。這一時期，阿拉伯民族主義是敘利亞的政治主流、掌權的則是遜尼派阿拉伯穆斯林，但可想而知，只將敘利亞定位為「遜尼派阿拉伯人的國家」，必然削弱少數族群的歸屬感，因此1953年敘利亞南部就爆發了「德魯茲起義」，最後被敘利亞政府軍強力鎮壓。
1963年復興黨人奪權成功後，敘利亞進入一黨專政時代，期間擔任防長、出身阿拉維派的的哈菲茲·阿塞德（Hafez al-Assad，通稱老阿塞德）又在1970年發動政變，並從1971年起擔任總統直到2000年，阿拉維派也因此躍升統治階級，得以控制敘利亞的軍隊、情報、官僚和安全機構，這又導致其他族群不滿。
同時在1970年代，敘利亞受到泛伊斯蘭主義影響，面臨激進伊斯蘭的政治挑戰，為首的主流勢力就是遜尼派的穆斯林兄弟會，目標是推翻世俗的復興黨政權、瓦解阿塞德的一人專政。各種流血事件最後導致敘利亞政府軍的強力鎮壓，代表事件就是1982年的哈馬大屠殺（Hama Massacre）：政府軍圍城27天，哈馬的三分之二被夷為平地，上萬遜尼派平民被殺，倖存者也大多經歷酷刑與性暴力。這場悲劇雖起於激進伊斯蘭騷亂，卻也受到阿拉維派與遜尼派的漫長仇怨驅動，最後又反向加深了雙方血仇，並且成為遜尼派武裝日後反對阿塞德政權的重要動機。敘利亞兩大據點一夕消失：俄羅斯轉戰北非蘇丹，插旗紅海打造新海軍基地更多文章
2000年巴沙爾·阿塞德（通稱小阿塞德）接班後，激進伊斯蘭勢力雖已不構成威脅，卻又輪到庫德族問題發酵。2004年3月，在卡米甚利（Qamishli）的一場足球賽中，一支當地庫德族球隊與一支來自代爾祖爾（Deir ez-Zor）的阿拉伯球隊爆發激烈衝突，雙方球迷也手持武器展開街頭混戰，平亂的安全部隊在混亂中開槍打死6名庫德族，足球暴力由此上升為族群衝突：憤怒的庫德族燒毀政府機關、推倒哈菲茲·阿塞德雕像，最後有超過2,000人被政府軍逮捕、超過30人被殺，數千名敘利亞庫德族為此出逃到伊拉克，事件又稱卡米甚利大屠殺（Qamishli Massacre）。
