卸除燃料後拆除
這些容器都是數以百計的核潛艇的遺骸。在美國華盛頓州布雷默頓，國防部在普吉特海灣的海軍造船廠（Puget Sound Naval Shipyard）的反應堆卸除操作生產出這些被稱為「三室單元」的密封、已經去除燃料的反應堆部分。
這是一個一絲不苟的作業流程。首先，退役潛艇被拖移至一個安全的卸除燃料船塢。核反應堆室內的液體在此被全部抽出，露出其核廢料組件。各組件隨後被拆除，置於核廢料桶內，裝上安全車，運往廢料處理廠作為長期廢料存儲。在美國，這些廢料由龐大的愛達荷國家實驗室的海軍核反應堆設施（Naval Reactor Facility）處理。在俄羅斯，西伯利亞的馬雅克鈈生產及再處理廠 （Mayak plutonium production and reprocessing plant）是核廢料的最終目的地。
儘管核反應堆機械（蒸汽發生器、泵組、閥門和管道）現在都不含濃縮鈾，但數十年的中子轟擊使這些部件的組成材料遭受重創，其中的金屬都呈現放射性。因此，在拆除核燃料後，核潛艇被拖移至乾船塢。工作人員用切割工具和噴燈分拆核反應堆室，將它們從核潛艇船體清空。
俄羅斯也使用上述技術，原因是西方擔心其不夠嚴謹的退役流程會導致裂變材料流入危險人物手中。例如，在賽達灣附近的安德發海灣（Andreeva Bay），俄羅斯仍存儲著 1960 年代至 1970 年代之間服役的 90 艘核潛艇的乏燃料。2002 年，八國集團啟動了一項為期 10 年、總值高達 200 億美元的計劃，旨在將普吉特海灣（Puget Sound）的退役技術傳授給俄羅斯聯邦。這項計劃通過為退役核反應堆建立陸地存儲碼頭，對北德文斯克（Severodvinsk）去燃料設施、拆卸設施及核廢料存儲進行大規模技術改良。
漂浮的威脅
博默表示，建立更為安全的陸地存儲之所以重要是由於核反應堆室兩側充滿空氣的艙室會帶來浮力，所以被遺棄的核反應堆一直在賽達灣附近漂浮。在海參崴附近的巴甫洛夫斯克 (Pavlovks) ，有54個核廢料罐仍處於漂浮狀態，繼續遭受惡劣天氣的影響。
但是，博默表示，這種情況下的退役流程並非總能實現的。有些前蘇聯核潛艇並未採用常見的壓水式反應堆，而是採用液態金屬冷卻反應堆，它利用一種鉛鉍混合物為反應堆核心散熱。在冷卻的退役反應堆中，鉛鉍混合物冷卻劑凍結後變成一種難以處理的固體塊。博默表示，有兩艘這樣的核潛艇仍未經歷退役流程。為安全起見，它們被轉移到非常遙遠的格拉米卡灣 (Gremikha Bay） 造船廠，這家船廠也位於科拉半島。
