教育部頒布的大學研究助理納保原則衝擊研究助理工作制度，各大學多強調學生與學校應屬「師生關係」，將助理工作劃分為屬教學課程學習、因此不需納保的「學習型助理」。台大工會前秘書長林凱衡強調，研究助理與校方應屬勞雇關係，並呼籲教育部檢討「學習型助理」的定義，並補足各大學聘用兼任助理需所需經費。
教育部今年6月17日頒布「專科以上學校強化學生兼任助理學習與勞動權益保障處理原則」，將大學校內的研究助理劃分為「學習型」與「勞雇型」助理，前者以學習為主要目的，不屬於僱傭關係，沒有勞健保；後者屬雇傭關係，校方需為學生加保勞健保、提繳勞退。
對此政策，目前各大學多強調學生與校方應是勞雇關係，因此多將研究助理歸類為「學習型助理」。如政大教務處長于乃明就表示，畢竟學生是到學校來讀書的，且勞健保保費會壓縮工讀的總經費預算，他們也希望多給學生一些工讀機會，因此希望學生選擇「學習型助理」。但于乃明強調他們還在討論。
勞健保保費壓縮工讀總經費
林凱衡表示，由於目前大學的研究助理共分成「研究助理」、「行政助理」和「教學助理」，但研究助理幾乎沒有納保，教學助理僅部分納保，行政助理雖然納保，但人員減少且工時增加，且也有行政助理被硬說成「學習型助理」，整體來說各大學都在逃避校方與研究助理的雇傭關係。
林凱衡指出，部份大學會請教授說服學生選擇「學習型助理」，例如政治大學。政大社會系教授苗延威也證實政大教務處有打電話給他，請他說服學生選擇「學習型助理」，不過他說這沒有強制性。苗延威也表示以個人立場他不認同「學習型助理」，畢竟研究助理和校方存在勞雇關係，雖然學校因加保而經費不足，但他認為加保是正確的方向。
另外，台大職能治療所將研究助理的工作設為畢業條件，透過開設「教學實習一」課程，要求碩博班學生必須選修此門課，選課學生必須參與「單一課程及全系的各類教學活動」，且每學期必須參與至少36小時。台師大則設立「師徒制」學習獎勵方案，強調教學助理是以學習為初衷，希望為過去教學助理制度解套，但高教工會指出，此方案與過去教學助理制度無異，校方與學生的勞雇關係仍然不變。
面對研究助理工作的變動，政大校務會議學生代表吳昭儒表示，學生面臨的直接衝擊是工時增加、名額減少、彈性的短工時工作消失。在「學習型」與「勞雇型」的分類上，學生則傾向選擇「學習型助理」，因為不需扣除保費，工作也較彈性，而且學生對未來就業抱持樂觀態度，認為畢業後可以找到更好的工作，因此退休後不需要現研究助理勞健保核發的退休金。
林凱衡批評，教育部劃分的「學習型助理」形同為學校開後門，逃避勞動成本，也便像以畢業條件和學分強迫學生工作，他也呼籲教育部檢討「專科以上學校強化學生兼任助理學習與勞動權益保障處理原則」，廢除「學習型助理」，並補足各大學聘用研究助理所需經費。
