基因表現 → 蛋白質產生 → 蛋白質回頭抑制基因表現 → 待蛋白質消失後基因再度活躍，這種循環是基因展現節律調控的原因。而這個循環會影響身體的晝夜節律、賀爾蒙分泌、體溫、細胞週期、代謝、免疫功能、消化運作、表觀遺傳學等複雜系統。
調控生理時鐘的「節律基因」很多具有「抑制癌細胞活性」的功效，因此當節律基因表現量被打亂、消除或過度表達時，都會造成細胞癌化的現象。
但是，光照造成的生理時鐘錯亂，增加癌化風險其一卻是不常曝光的胸部。黃雯華指出，當生理時鐘出現問題的時候，人體的免疫力較差，同時會因為細胞(通常都是纖維母細胞)釋放出細胞激素 (cytokine) 等促進發炎的小分子，而使身體趨向半發炎的狀態。
於是，發炎因子會讓乳腺表皮細胞裡面的節律基因 (PER、CRY) 產生變化。目前觀察到明顯的變化就是 PER 基因系列中， PER2 受到抑制。當 PER2 基因的表現往下掉，本來應該要一個接一個整齊排好的乳腺表皮細胞，會開始亂鑽、一層疊一層，並且展現不正常的活動力。
黃雯華認為，發炎因子讓 PER2 表現降低，原本被抑制的癌化基因就開始活動，促使正常的乳腺表皮細胞出現異常的侵襲力，這是促進癌化產生或是增加的機制之一。
儘管實驗室目前進行的研究只是生理時鐘複雜機制中的一小部分，無法解釋、解決所有的問題。但黃雯華強調，不管是人類還是小鼠，體內有 40% 到 50％ 的基因表達，都直接或間接地跟生理時鐘的節律基因相關。「生理時鐘一出問題，這些癌化基因表現就會受到影響」黃雯華說。
各器官也有自己的生理時鐘！
除了生理時鐘與乳癌的關聯性，黃雯華也指出，身體裡面不同的器官都有屬於自己的生理時鐘。而大腦的生理時鐘，是最主要的生理時鐘 (Master Clock)。
不同器官裡各自的生理時鐘，除了對於器官本身的功能很重要外，還會跟大腦的生理時鐘連結合作，一起調節整個生物體的平衡。
以腸胃道來說，臺灣大學生命科學系陳示國副教授發現，小鼠接收不同波長的光照，腸胃道的菌叢就會不一樣。雖然大腦與腸胃道雙方生理時鐘的協調機制還不明瞭，光照時間是否會影響腸胃道的修復也還在觀察中。但很明顯的是，若是腸胃道的生理時鐘因光照被打亂，消化吸收功能與腸胃道菌叢會受到影響，並牽連整個身體的健康狀態。
至於癌細胞，理論上來說，快速分裂的癌細胞應該會具有異於正常細胞的生理時鐘。黃雯華提到，如果能找出兩者生理時鐘的最大差異，挑在正常細胞具有較佳修復能力的時間點給病人吃藥，便有機會對癌細胞造成傷害，而正常細胞只會有最小的副作用。
