（1954年）九月三日，毛澤東命令對離大陸只有幾公里的國軍占據的金門島開炮。毛的目的祕而不宣，但人們普遍認為毛在準備打臺灣，因為金門島可被用作進攻臺灣的跳板。美齡在十月飛回臺灣去，與丈夫共患難。
毛咄咄逼人的動作，促使華盛頓跟臺灣簽訂了「共同防禦條約」，正式承認蔣介石政權是代表全中國的唯一合法政府，並占據聯合國內的「中國」席位。蔣介石把「反攻大陸」作為基本國策。這是他要保持聯合國席位必須做出的姿態，也是他的夢想。這也給百萬國軍官兵和家屬，以及其他背井離鄉跟蔣逃來臺灣的人以希望，有一天他們會重歸故土，與留在大陸的親人團聚。
毛澤東的炮打金門讓美齡痛感「共產主義侵略的威脅」。從大陸傳來的關於國民黨人和他們的家屬如何慘遭迫害，被掃地出門、被清算鬥爭、被逮捕槍決，等等，早已叫她恐懼憎惡。一天晚上，她從夢中哭醒，蔣問她怎麼回事，她說夢見慶齡跟她道別，她害怕姊姊已經被殺害了。
美齡開始把丈夫看作臺灣的捍衛者，開始同情他為此而使用鐵腕，哪怕是帶血的鐵腕。夫婦二人又重新親近了。蔣寫作他的重要著作《蘇俄在中國》，美齡跟他合作編輯英文版。在「作者的話」裡，蔣介石寫道：「今天，一九五六年十二月一日，我的妻子跟我靜靜地慶祝我們的結婚紀念日。」以蔣一貫的母親崇拜的風格，他把這本書莊重地「獻給我們神聖的、最親愛的母親──已故的蔣王夫人和已故的宋倪夫人。獻給她們這本書，象徵著我和我的妻子決心再次把我們奉獻給上帝交給我們的最大使命〔即『反共抗俄』〕。我們為此將竭盡全力，不辜負母親對我們的培養」。
在蔣身邊的美齡，對蔣的嚴酷鎮壓起了柔化作用。她聘請了美國南方浸信會神學院博士周聯華做蔣家的專任牧師，並派他到監獄去傳教。一位在「綠島」被囚十年的政治犯後來寫道：每天在綠島上的生活是苦役勞動、精神虐待、人格侮辱；每分鐘都被政治化，朝夕必結隊高喊「蔣公是民族救星！」「殺朱〔朱德〕拔毛！」；朝夕必唱「反攻、反攻、反攻大陸去！」周牧師的到來，營造了一種非政治的氣氛，給他們「帶來了空間和時間上的短暫解放與寧靜」。他讓囚犯感覺自己是個「人」。當周牧師開口稱他們「女士們、先生們──」時，囚犯們「當時剎那間的感受，直如天籟，『自我』從毛孔裡神聖起來」。讀《聖經》時，「藉由上帝的口，傳布了若干的人間信息；點點滴滴，豈止聊勝於無；荒漠甘泉，瓊漿玉液啊！」情治人員不喜歡牧師，但有美齡撐腰，他們拿他沒辦法。
一九五八年，美齡再度赴美，這次在美國各地旅行，演說共產主義的威脅。就好像是在為她的演說提供實例，毛澤東在八月再次炮打金門，朝小島發射了數萬枚炮彈。美國人對美齡的演講報以激情的反應，對臺灣的支持率上升，這鼓舞了國民黨的士氣。毛的舉動再次幫助鞏固了蔣介石的統治。
