以空降之姿成為首都市長辦公室主任，蔡壁如認為這反而是好處，可以發揮「鯰魚效應」，因為「完全沒人認識，正好方便重新定義企業文化。」市長辦公室眼見所及，幾乎沒有列印資料，就是她盡量做到無紙化、取消訂報的成果，「原本就不該浪費納稅義務人的稅金。」
過去，台大醫院葉克膜團隊（ECMO Team）大約20人，是個小單位，每天碰到的都是專業問題，由專業解決。而今，市政府是一部有8萬6千名員工的大機器，蔡壁如為了實現柯文哲曾說的「最好的管理就是不用管理，最好的管理是自主管理」，當務之急就是建立追蹤機制（monitor mechanism）讓系統自動追蹤，以及規範各種標準作業流程（SOP）與檢查表（checklist）。
接任辦公室主任的第一個星期，她就著手建立「市長行程資料庫」，將市長行程進行量化分析和根本原因分析（RCA，root cause analysis），藉此優化市長未來的行程，減少不必要的曝光。
第二個星期，她繼而建立「追蹤事項資料庫」（類似專案進度控管），一個月就多達323件。每周五，相關單位都會收到她的e-mail提醒跟上進度。
蔡壁如表示，柯文哲一旦決定的事情就會貫徹到底，因此，充當柯文哲對外溝通的平台，「讓別人了解你的政策」，占據了她絕大多數的的工作量，也是她最重要的工作，過去如此，現在還是如此。
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