屏東工業區已開發超過50年且地處於屏東市中心，當初工業區設立時並未設置污水處理廠及鋪設工業區專用的污水下水道，導致長期以來工業區的廢污水都直接排放到殺蛇溪，造成殺蛇溪的水質汙染嚴重，有鑒於此，縣長潘孟安於2017年開始就數度向中央爭取建設屏東工業區污水處理廠，並與經濟部工業局共同努力下，28日終於完成污水處理廠及管線鋪設工程，經濟部工業局副局長陳佩利也蒞臨現場，參與今日的啟用儀式。
潘孟安表示，屏東工業區污水處理廠的完工，是一個地方政府與中央部會共同努力一起保護環境、永續環境的最佳典範，水環境的維護及建設一直是屏東縣府團隊的施政重點，而殺蛇溪和萬年溪一樣都是貫穿屏東市中心的重要河川。縣府過去致力於萬年溪流域整治，在上游建置6座濕地處理水質，其成果有目共睹。屏東工業區污水處理廠於今啟用後，不僅能提升殺蛇溪沿岸水體環境及生活品質，後續也期望藉由整治後之乾淨水源引入縣民公園，更能展現出縣民公園水岸廊道之氛圍。
屏東工業區汙水處理廠，總經費共計1億8,755萬元，每日處理廢水量為1,200公噸。該污水處理設施為三級處理，工廠的廢水收集後經過攔污柵，沉沙池，調整池、快混及慢混、厭氧-缺氧-好氧(A2O Process)、最後再經過快濾及活性碳吸附後，處理水質可符合放流水標準，大大降低殺蛇溪的污染負荷，也可以讓民眾於縣民公園遊憩時感受到殺蛇溪清澈的水質。
近年來，屏東縣政府針對殺蛇溪流域進行多項的整治工程，包括於殺蛇溪沿線進行截流井鋪設及污水下水道建置，將排放至殺蛇溪之生活污水進行截流至污水下水道系統中，並引流至六塊厝污水處理廠進行處理。另外，在上游處，屏東縣政府持續推動沼液沼渣肥分再分利用於農地，以降低上游之畜牧廢水排入河川，縣府環保局也即將於殺蛇溪上游處建置水質淨化場，本案目前已完成規劃設計，預計於今年4月底動工，並預估明年初完工，本案每日可截流殺蛇溪水量1萬公噸進行處理。
