曾經轟動一時的雙子星聯合開發案，涉及金額達上百億，龐大利潤引發數起爭訟，而柯文哲就任市長後，此案便停擺了1年半，如今才又再度重啟。不過面對前5次的流標，在第6次正式對外招標前，台北市政府將先動支市庫4000萬元，開「總顧問」標，這筆金額是郝龍斌時期雙子星顧問標的40倍。
捷運局解釋，這是要借重顧問公司對市場的敏感度與專業經驗，就法律、財務、工程等面向進行全盤評估，找到投資人並設下「保證不流標」機制，即必須與開發商簽約，才付總顧問尾款的機制。
柯：雙子星民間總投資700億 規劃案價格比較高
對於4000萬的數目，柯文哲表示，台北市做事前研究規劃，之前每個案子編的錢都不一樣，後來就定下規則，先期規劃費設定為「民間預計總投資額的1600分之1」，或是「政府預期收入的900分之1」，以這兩個標準來決定規劃案的金額，柯文哲表示，他知道大家看到4000萬會嚇一跳，但因為雙子星案民間總投資額是700億，是一個很大的案子，地段很貴，規劃案的價格就會比較高。
至於有議員質疑是否會是另一個弊端的開始？柯文哲回應，「我們事先也想到了，把以前發生過的問題，全部都SOP化、規則化，包括制度有哪些」，他說，很多人反對SOP，但SOP最大好處是讓大家有固定的規則可以遵循，大部分情況是好的。
市府與開發主簽約後，才交付顧問標尾款
由於雙子星案已有5次流標的經驗，柯文哲上任後，著手第6次的對外招商時，為防止花了鉅款顧問費又流標的情況，因此在設計顧問標時，設下唯有市府與開發主簽約後，市府才交付顧問標尾款的標案形式，即總顧問要保證不會出現第6次再度流標。至於時間表，王偉說，預計明年底對投資人公開展覽標案，採國際標，也不排除由一家投資人領銜得標，找國內數家投資商合作開發的模式。
而4000萬這個數字，是郝市府時期顧問標案的40倍，這又是如何評估的？台北市捷運工程局主任秘書王偉指出，4000萬是暫時的估價，是市府財政局就促參案設下的門檻，採用民間總投資額的1600分之1計算出，他解釋，若以雙子星建造費介於600-700億之間計算，1600之1約為4000萬。
4000萬尋找「總顧問」議員：市府已有600多個顧問
王偉也說明，4000萬是尋找「總顧問」的費用。王指出，過去雙子星在對外招標前期，也有開顧問標，但僅限於「財務稽核顧問」1項，標金也不到100萬元，但考慮到政府對市場的敏感度、專業經驗不如民間顧問公司，因此，本次才會構思用「總顧問標」的方式，意在對外正式招商前，先就法律、財務、建築等相關面向找一個「總顧問」，經評估後替市府製作招商文件，及尋找潛在投資人。
不過，該筆預算已讓許多市議員感到不滿，認為市府內有600多個無給職市政顧問，為何仍需花大錢、外求顧問？對此，王偉解釋，市政顧問本身都有工作，無法專職跟著計畫一直走。
由於柯市府對前朝幾十個聯合開發案的權益分配「很有意見」，認為少收很多錢，要求全盤檢討，而在雙子星聯合開發案的權配比方面，王偉說，郝市府時期設下市府至少分回50%的權益比率，柯市府將再次檢討此權配比適當與否。
雙子星案的惡名在前，第5次招標時，由太極雙星取得優先議約，後爆發弊端由第2順位的中華工程遞補，但又涉其他爭議，致中華工程數度提告北市府，市府不願再由第3順位得標，因此流標。
柯市府上台後，雙子星案停擺長達1年半，才開始顧問標，市府究竟在等什麼？王偉解釋，是為了配合「西區門戶計畫」的周邊工程，且中華工程去年與北市府仍有數項法律訴訟案在進行，為了不影響爭訟所以先擱置，王偉指出，北市府目前還有2個案子與中華工程爭訟中，在不影響對外招標的情況下，才啟動雙子星正式招標前的「顧問標」程序。
