研究海外台獨運動的陳昱齊說，他過去的研究，到檔管局等機關申請檔案，也要等很久，因為他們要處理遮掩個資等作業，但「能等得到，都是小事」，如果申請外交部檔案，等候許久卻不能看，「豈不是會崩潰」；他因此只能先擱置後續的研究，等外交部改變規定，或等檔案從國史館移轉到檔管局後再申請，外交部的做法讓研究者處於非常不確定的狀態，「都什麼年代了，研究者竟然還要擔心，因為檔案需經審查，可能被駁回，就不敢申請，研究就必須擱著。」
碩博士生寫論文 先考慮檔案可及性
面對研究檔案的困難，有研究司法史的歷史學教授透露，她沒有畢業壓力，有時間「熬」，但碩博士生研究論文題目，就要考慮相關檔案的可及性；她知道有人申請60-70年前的釣魚台檔案，凡與釣魚台相關的，都以「事涉機密、不宜公開」為由遭駁回，「我們都開玩笑地說，是不是應反過來講，檔案事涉機密，但已超過30年，可以公開」，檔案管理機關應該「反轉思考」。
外交部回應：避免有違《檔案法》規定
外交部對此回應指出，外交部移轉至國史館的檔案是1979年前的檔案，依《國家機密保護法》，均已超過最長30年的保密期限，外交部已同意全數概括解密；然而，依據《檔案法》第18條，檔案若有關係到國家機密、犯罪資料、人事及薪資資料、其他為維護公共利益或第3人之正當權益等7種情形，可以拒絕外界申請查閱應用，因此，為求審慎，避免有違《檔案法》第18條規定，才請國史館在外界申請閱覽應用時，先函外交部予以個別審查。
外交部指出，資訊開放應用是政府既定政策，為簡化行政流程及縮短審查所需時間，外交部將協調國史館研議修訂申請閱覽及應用相關檔案的流程。
周曉雯16日受訪指出，《檔案法》第18條是可引用的依據，但外交部每案都要審查的確是「有點曠日費時」，國史館已聯絡外交部，近日將正式行文，讓外交部能內部簽辦檢討此規定，「我們希望至少某個年代前已經解密的檔案，在檢視有無個資問題後，就可提供閱覽」，但主要還是要看外交部的意見。
