一、朝鮮半島核問題：中國白皮書指出，長期以來，中國為推進半島無核化進程、維護半島和平穩定大局、推動儘早重啟六方會談作出不懈努力。白皮書指責美國和韓國不顧中國明確反對，推進在韓國部署「薩德」反導系統，嚴重損害中國的國家安全利益。美國對此持不同的看法，準國務卿提勒森在1月11日指責中國在處理北韓問題上「沒有盡全力阻止北韓發展核武，顯然已不是可靠的夥伴。」稍早的1月2日，川普在推文直陳：「中國在完全一面倒的貿易中，賺走美國钜額金錢與財富，卻在北韓議題上不幫忙，很好！」雙方在朝鮮半島核問題上互相抱怨，分歧嚴重。
二、南海問題：白皮書指出，中國對南沙群島及其附近海域擁有無可爭辯的主權。中國始終堅持通過談判協商和平解決爭議，中國堅決反對個別國家為一己私利在本地區挑動是非。對於侵犯中國領土主權和海洋權益、蓄意挑起事端破壞南海和平穩定的挑釁行動，中國將不得不作出必要反應。任何將南海問題國際化、司法化的做法都無助於爭議的解決，相反地只會增加解決問題的難度，危害地區和平與穩定。面對中國強勢的態度，準國務卿提勒森認為美國必須要讓區域盟邦清楚瞭解，美國的承諾不變，他還傳遞「清楚訊息」給中國：「一、中國在南海造島的行為必須停止，二、中國將不被允許進入這些島嶼。」他批評，中國在南海造島、部署軍事設備的行為，「就像俄羅斯控制克裡米亞」，佔領其他國家也宣稱擁有主權的領土。準國防部長馬提斯也指出中國持續在南海增加軍事部署，是破壞與鄰國的誠信。他強調美中兩國必須嘗試互動溝通，但如果中國選擇做出有違美方利益的舉動，美國必須做好準備，面對這種不適當的行為。
三、東海問題：白皮書指出，中日在東海存在釣魚島問題和海域劃界問題。釣魚島及其附屬島嶼是中國的固有領土，中國對釣魚島的主權有著充足的歷史和法理依據。中方願繼續通過對話磋商妥善管控和解決有關問題。對此，準國務卿提勒森批評中國在東海劃設防空識別區是「非法行為」、「他們佔領、控制甚至宣稱不是他們的領土。」他說，若中國軍隊試圖奪取釣魚島，「我們將根據美日間的協議進行應對」。
四、網絡安全：白皮書指出，中國是網路安全的堅定維護者，支援並積極參與國際社會加強網路安全的努力。中國主張建立多邊、民主、透明的互聯網國際治理體系，認為當務之急是在聯合國框架下制定各方普遍接受的網路空間國際行為準則。1月11日，川普公開指稱中國入侵美國2200萬電腦帳戶，明顯表示中國表裡不一。隔日，川普任命前紐約市長朱利安尼，在其政府中擔任網絡安全顧問。川普表示，網絡入侵在美國和全世界正成為發展最迅速的罪行，且對美國國家安全構成嚴重威脅。而準中央情報局局長蓬佩奧也認為中國在網絡空間的活動創造緊張關係。
