CNN表示，伊波拉防疫挫敗，部分歸因於WHO繁瑣而複雜的官僚體制。該組織由6個區域辦事處、150個國家辦事處組成，日內瓦總部難以即時指揮、控制各地辦事處。
此外WHO通常不會派駐團隊在世界各地收集疾病信息，而是依靠會員國提供數據，這些數據在通報給WHO之前，又可能須先通過各國政府與區域組織「過濾」。這意味著，WHO只能知道成員國願意讓它了解的情況，如果一個國家正有流行病肆虐，但不共享數據，WHO也無能為力。
造成伊波拉疫情失控的其他因素還包括，派遣至疫區的專家小組人力不夠、資金不足，以及西非各國政府不願承受PHEIC宣言造成的經濟打擊，向WHO施壓。
武漢肺炎疫情爆發，WHO與中國關係受矚目
儘管伊波拉病毒疫情已經突顯WHO組織內部的弊病有多嚴重，衣索比亞前衛生部長譚德塞3年前當選為WHO首位非裔總幹事時，也曾承諾進行大規模組織改革，但是2020年再遇到流行病大爆發，WHO依然沒有辦法脫離被批評的惡循環。
這次的重疫區在中國，一個資訊透明度不足、又對國際批評很敏感的國家，2019年底就有新型冠狀病毒確診案例，直到今年1月20日才承認病毒可以人傳人。然而近幾周來，WHO多次讚揚中國的防疫表現。
1月28日在北京人民大會堂，譚德塞與中國國家主席習近平並排而坐。譚德塞稱，世界衛生組織高度讚賞並充分肯定，中國政府對新型冠狀病毒疫情採取的果斷措施，以及所表現出的透明度。短短一個星期後，譚德塞再次現身媒體前，宣布全球進入公共衛生緊急狀態，仍高度讚賞中方對於疫情防控的努力。
台灣被WHO拒於門外，體現中國在該組織的影響力
聯合國旗下機構依靠資金和成員國的合作來運作，這給予中國、美國、日本這樣的富裕成員國很大的影響力。從台灣問題可見，北京對WHO的政治影響力有多強大，該組織的宗旨是「使世界各地的人們盡可能獲得高水準的健康」，然而台灣卻多次並屏除在全球防疫網絡之外。
台灣曾連續8年受邀以觀察員身分參與世界衛生大會（WHA）；但因中國打壓，台灣2017年起連3年未能獲邀參與。2019年，我國友邦於WHA仗義發聲，聖文森衛生部長布朗（Luke Browne）指出，中國並未對台灣行使主權，這兩個是獨立且不一樣的政府，「不能期望中國在這裡代表台灣」，台灣以前能以觀察員參與，現在無法參與，原因就是北京不喜歡現在的台灣政府。
國際衛生政策須仰賴所有國家政府平等地聯繫、分享信息，才可能有效。澳洲智庫「洛伊研究所」（Lowy Institute）亞太外交專家卡薩姆（Natasha Kassam）告訴CNN：「台灣被WHO拒於門外，該國人民在這場危機中處於極易受創的狀態，缺乏直接和及時的溝通渠道，已經導致台灣病例報告不準確。」
