安倍晉三與菅義偉（內閣官房長官）讓內閣官房職員們「撩下去」，安倍自己當然也沒閒著，幾乎每天都在「新型冠狀病毒對策本部」（首相官邸）召開會議，根據內閣官房的公開資料，這個對策本部的本部長就是安倍本人，副本部長則是官房長官菅義偉、厚生勞動大臣加藤勝信。值得注意的是，這三人都沒有公衛與醫學背景，率領作為本部成員的所有大臣開會討論對策，其決策品質可想而知。
其實這種治理模式在安倍政府屢見不鮮，明治大學公共政策研究所教授田中秀明曾經批評，安倍執政後拋出「安倍經濟學」（安倍三箭）、「一億人口總活躍」、「人生100年時代」等響亮口號，內閣也隨之冒出許多委員會研究這些政策。問題是，這些委員會提出的也大多是「計畫」、「方針」，並未針對問題本身進行分析，只是營造出一種「有在工作」的感覺。
面對時間壓力不那麼緊迫的社會與經濟議題，無論是景氣復甦抑或是少子化，這種「官邸主導」的方式或許展現了某種雷厲風行，但這次面對需要醫療與公衛專業的防疫課題，加上做出各種決策的時間壓力，都不容安倍政府的半調子「官邸主導」模式作作樣子。
這次安倍對武漢肺炎喊出了的口號是「水際對策」，強調要將疫病阻絕於國土之外。「鑽石公主號」的三千多名乘客與船員，在最初十幾天確實被隔離於國土之外，但在外行領導內行的情況下，這艘船竟成了全球群聚感染最嚴重的疫病之船，加上後續的隔離與下船決策更是一團混亂，除了日本的確診人數因此高居全球第二，已經自行搭乘大眾交通工具返家的潛在帶原，恐怕日後更將對日本的醫療系統構成龐大壓力。
雖然安倍幾乎每天召開會議，親自拍板防疫決策，但除了缺乏公衛專家與會之外，日本醫療管理研究所所長上昌廣也公開撰文批判，主導「鑽石公主號」原船隔離的政治家未能妥善思考健康與人權的嚴肅議題，滿腦子都是東京奧運開幕與自身支持率的雜念，才會做出離譜的隔離決策。
安倍政府日前雖然表示，「應該設立類似美國疾病管制與預防中心（Communicable Disease Center，CDC）的機構」，才能妥適收集情報、聽取專家建言、對各省廳統一指揮。《日本經濟新聞》也指出，美國CDC一年預算8000億日幣、職員1萬4千人，日本的國立感染症研究所不過308名研究者、預算65億日幣，似乎無法勝任面臨重大疫情的指揮功能。
不過睽諸安倍的施政領導風格，就算真的砸了重金、成立了日本的疾管局，但要是臨事依舊是首相成立對策本部因應，每天大拜拜15分鐘（這是日媒《女性自身》的統計數字，而且安倍的平均出席時間不到12分鐘，確定媒體拍到出席鏡頭後，便趕去跟政要晚餐），屆時疾管局局長恐怕也只是列席聽訓，再由內閣總理大臣拍板。況且大疫在前，日本並非沒有感染症專家，任由政治考量凌駕公衛專業的問題現在就可以改、並非公衛醫療專業的厚勞大臣現在就可以換，如若把希望寄託在虛幻的設立新機構上，這次日本的疫情恐怕還看不到盡頭。
