交通部觀光局為因應新型冠狀肺炎影響，自109年「4月1日」起至「8月31日」補助各直轄市及縣（市）政府，藉以推動及鼓勵所轄合法旅宿業者加入「防疫旅宿」，提供居家檢疫者安心入住選擇，以配合全國防疫工作、降低社區感染風險。疾管署也從3月起規定不論本國籍或外籍，「所有入境人士一律都要居家檢疫14天」，實際上不計算返台當天，亦即所有入境人士都得在防疫旅館或符合規定的隔離地點、宿舍、住家，入住15天，方能符合規定。
疫情沒停歇但防疫旅館規劃卻有時間性
從2019年12月疫情在中國爆發至今，已近9個月，全球各地，尤其國人往來頻繁的美國仍舊疫情毫無停歇。臺灣不僅國人陸續從疫情嚴重的海外返臺，還陸續開放外籍人士來臺就醫、就學、商務、探親等。根據內政部及觀光局發佈的最新統計資料顯示，6月份來台旅客主要來自中國大陸、美國及日本，總計來台旅客（含無戶籍之本國國人）近7,500人次，而持中華民國護照入境之有戶籍國人近25,000人次，意即光6月份單月來（返）台人次約32,000人。從疫情指揮中心開放商務客入境、部分境外生返台就學等新作為下，在可見的未來近幾個月，防疫旅館仍舊存在高度需求，因此全臺各地檢疫空間是否足夠，2.6億防疫旅館補助經費是否已告罄，應該提早檢視並予以因應。畢竟臺灣目前疫情似乎在控制之中，但全球疫情尚未減緩，在入境人士逐月增加的情況下，入境後隔離的規定與執行，仍是避免臺灣防疫付之一匱的做法之一。但若防疫旅館數量不足，入境人士的隔離管制，將受到影響。
各縣市政府跟防疫旅館各自為政
據統計，全台防疫旅館維持在150家左右，提供9,500房間數，從7月過後全台防疫旅館住房率一路成長超過五成，其中，北部地區防疫旅館由於資訊透明、公開旅館名稱業者數量居全台之首，品質與選擇也較多，7月入住率更飆達9成。但除了北部地區防疫旅館資源較完備外，以高雄市為例，防疫旅管不管是公告名單，或是衛生局提供的不公開業者，皆幾乎已沒有空房，或是無法連續提供15天的隔離住宿期，提供返（來）台人士入住隔離。甚至目前許多由疾病管制局1922專線分配的防疫旅館業者皆表示9月起價格將變動，或不確定是否繼續承接防疫工作。此可能跟政府目前公告補助只到8月31日，以及國旅及觀光局推出「安心旅遊」，使得部分防疫旅館退出，改衝國旅商機有關。就防疫旅館一房難求的現況，再加上入境旅客不同需求，若使用者自願不領合法旅館隔離之補助，尚有其他通路（如Airbnb）等房源作為隔離地點的選項，只是會不會是另一個防疫缺口，恐怕相關單位也得一併考量。
