為部署跨國產業大戰，教育部近期擬以半導體等重點領域產業為範圍，開放於國立大學設立相關領域學院，各校每年2億經費中並有一半由企業出資，該學院除享有獨立預算外，人事、財務等法規限制也將鬆綁。但對此，教團、立委質疑，此舉恐讓高教向企業傾斜；高教工會以過去馬政府「大學自經區」為案例，指出最後反而造成如高餐與藍帶學院合開的專班，除淪為收取105萬高額學費的補習班外，更讓學校投入上億資金給藍帶學院，並排擠原來校內師生資源。
總統蔡英文於520就職演說曾表示，要打造六大核心戰略產業，包括強化資訊及數位相關產業發展等。而隨全球半導體大戰開打，在企業界反映人才需求下，教育部擬推出法案，以實驗沙盒精神，推動包含半導體等國家重點領域研究學院；該學院由國立大學申請後，將設置於各大學下，並以外加名額方式，每年招收碩士80人、博士20人，各校每年預估經費則為2億，其中一半擬由企業出資。
據了解，教育部規劃下該學院雖為大學附屬機構，但於人事、財務皆獨立運作，包含有不受校務基金影響之獨立預算，並擬定鬆綁生師比、修業年限、招生規定、學位授予等規定，如開放可學士畢業生報考博士等；此規劃期盼本會期由立院通過，明年上半年正式受理國立大學申請、許可設立，並於110學年度啟動招生。
指馬政府有前車之鑑 高教工會：淪占高教資源高價補習班
但對於此做法，高教工會組織部主任林柏儀便表示擔憂。他指出馬政府時代，曾企圖在自經條例框架下，透過大學自經區概念，開放大學和國外大學合作，開設分校或學院等，儘管自經條例最後並未通過，但當時教育部仍以行政命令方式偷渡，開放大學開設相關專班，並鬆綁《教師法》、《學位授予法》等法規限制。
林柏儀批評，當時開放的專班，不少都收取高額學費，如高雄餐旅大學跟法國藍帶學院合作的專班，1學年學費高達105萬，校方更耗費上億為藍帶改建教室，卻無經費修繕原來校內廚房，藍帶每月僅需花費10萬租金，便可租下整棟校內大樓，不僅排擠原來師生的資源，也是把學校資源廉價輸送出去，成立占用高教資源的高價補習班。
林柏儀也指出，教育部2010年曾推行大學自主治理方案，透過設立類似企業董事會的自治委員會，將大學法人化，委員會可決策學雜費調整、招生名額等重大事項；且委員會中有將近半數為外部人士，將取代原來的校務會議，原本擬由成功大學、金門大學試辦，但後來在師生強烈反對下，也遭到校務會議壓倒性否決。
林柏儀認為，不論自主治理計畫或大學自經區，教育部所思考都是相同邏輯，認為去管制化就可以提升高教品質，結果卻讓好不容易累積的公共資源輸送給資方，如今又沒學到過去經驗。
