老師雖曾叱吒風雲於一時，但說放下便放下。抗戰勝利後，「滿洲國」結束，老師即退出政壇，「不再涉入政冶」，「龍德而隱」，另闢新天地，師法孔夫子，投身教育事業，以申其復興華夏學術文化之志，為整個中國謀幸福，真「長白又一村」也。
民國三十六年來台，隨後即赴偏鄉台東興辦山地農校（省立台東農業職業學校），擔任教導主任，教出楊傳廣等學生。其間並走訪各地搜集歷史資料，主編《台東文獻》。為了保留清代最後一任知州胡傳（字鐵花，胡適父親）的歷史記憶，老師特別點校胡傳撰著的《台東採訪修志冊》，更改台東火車站前路名為「鐵花路」，立胡鐵花紀念碑。為了讓學生能切身經驗熟悉民主政治，老師還帶領著農校學生協助辦理台東第一次民選縣長選務。
毓老師傳道外國學人
民國四十三年一月二十三日，韓戰反共義士來台的「自由日」，蔣介石總統卻在這天以「沒事少離開台北」，傳召老師返回台北，幽禁於陽明山，日記也遭繳沒，「自由日」變成「不自由日」。
幸而脫離苦難之後，受胡適之託，老師開始教導外國學生讀古籍，先後教過魯道夫、魏斐德、簡慕善、席文、范力沛、吉德煒、班大為、孟旦、黃宗智、夏含夷、包弼德等日後著名美國學者，以及一些加拿大、英國、韓國、日本、越南學者如高麗大學朴元熇教授。民國五十九年，美國學者以魏斐德為首，特別編印《無隱錄——劉毓鋆榮譽紀念論文集》（Nothing Concealed : Essays in Honor of Liu Yu-yun）為老師賀壽。老師生平素不滿近代洋人霸權作風，為何還肯教授外國學人？老師認為：洋人霸權作風是「文化背景始然」，「明乎此，莫急於傳華夏文化於人類，促其知仁之為道在於愛人。斯易世之不二法門也。」
毓老師初收本地學生
老師先收洋人學生，為何不先收本國學生？可能因為國四十年代初，局勢嚴峻，文網縝密，為避免政治壓力吧！直到民國四十七年，老師才私下收少數幾個本國學生，謝深仁、黃大炯等，五十年代以後來才陸續有陳一川、阮芝生、孫鐵剛、徐泓等。當時，老師尚未開班授課，只是個別指點，如賜書黃大炯：「學不可緩，亦不可急，緩則怠而無功，急則進銳而退速。」在此期間，老師與佛教界多所來往，曾參與紀念金身不壞的慈航法師的慈航中學創校，也參與星雲法師在宜蘭創建雷音寺。
毓老師與中國文化大學哲學系
民國五十六年，老師接受張其昀的邀請，到中國文化學院（今中國文化大學）任教。講授《孔孟荀哲學》《易經哲學》《學庸哲學》《陸王哲學》，並擔任系主任，撰寫系歌：「格致誠正，修齊治平，內聖外王。拳拳時中，終乎至善，始乎明德。時乘六龍，位位乾則，元毓休暢。乾仁合和， 羣龍無首，大同天德。」系內實行導師制，老師與學生朝夕相處，個別或分組指導學生，讀中華經、子寶典，並以身教言教傳授為人處世之道。老學生林義正、陳文昌、李濟捷等至今仍常津津樂道受教如沐春風之樂。
