華航機師染疫風暴擴大到校園，連日來，疫調已發現十多人感染，機師感染事件卻仍查不出源頭。國內感染科專家警告，台灣早已形成隱形傳播鏈，本土病毒一直沒有消失，機師很可能就是在台灣本地感染，而病毒得以傳播的主因，是長期未進行篩檢的後果。國人普遍認知到蔡政府疫苗採購黑箱作業的負面影響，被籠罩在無知之幕下的惡果正逐漸浮現。
民眾憂心「社區感染」形成之際，中央疫情指揮中心指揮官陳時中認為「言之過早」，因為染疫機師在國內、國外兩邊跑，自國外染疫的風險較大。指揮中心與民間專家的認知落差甚大。從防疫這段時間來，中央疫情指揮中心對國會立委、對地方政府、對社會大眾的溝通不順，逐漸形成三層無知之幕。
第一層是國會立委無法掌握新冠疫苗價格、供貨時程。中央流行疫情指揮中心多以「簽訂保密協定」為由，不願對外說明。立法院衛環委員會3月中旬召開「秘密會議」，但藍營立委在會後表示，秘密會議根本「沒有秘密」，所有相關於疫苗採購的問題，全部以保密協定為由不說明，台灣採購AZ疫苗「買貴了」的傳聞甚囂塵上。國民黨團要求設立「疫苗採購調閱專案小組」，卻引發民進黨團不滿，雙方一度爆發衝突，直到最近，民進黨團總召柯建銘才釋出善意。
根據台灣民意基金會最新調查，近半數（47％）國人認為，蔡政府的疫苗購買不透明，擔心中央有黑箱作業。為什麼台灣現在只有AZ疫苗？為什麼第一批AZ疫苗有11.7萬劑3月初抵台、6月15日到期，第二批AZ疫苗有19.9萬劑4月初抵台，卻在5月底就要到期。新到的疫苗，反而更早過期，這是怎麼回事？難道是歐洲國家爆發AZ疫苗有血栓副作用疑慮，才把貨倒到台灣來？
第二層是縣市地方政府沒掌握到疫調資訊。3名印尼籍華航機師確診個案16日參加台北清真寺活動，現場包含65名台灣科技大學師生在內有400人，台北市副市長黃珊珊居然是「看到新聞才得知此事」。照理，北市疫調由北市衛生局處理，但台北市府都沒接到中央通知疫調資訊，而是看到新聞跑馬燈才知此事。中央與地方之間的疫調資訊不暢通，無法上情下達，台北市長柯文哲因此在臉書質疑：「我們竟然像是蒙著頭作戰，這樣（防疫戰）能贏嗎？」
第三層是對社會大眾沒有大量進行核酸檢測（PCR），也沒有疫苗施打潮。台灣民眾不願自費進行核酸檢測，因為一次要花新台幣7000元，價格是中國大陸的20倍。核酸檢驗試劑都是國產，不需進口，自主研發出來之後，再由衛福部疾管署技轉出去。為什麼還是貴到離譜？陳時中自豪地說：「因為我們的最準！」但真的最準嗎？如果檢驗最準，為什麼印尼籍華航機師在台灣沒有驗出來，而是到澳洲才被驗出來確診？
