同一時間，高中通識教育科被「殺科」。該科目以往是高中必修科，強調培養批判性思維、關心時事，但被北京和港府認為是激發學生參與社會運動甚至仇中情緒的源頭。今年4月，香港教育局把通識科改頭換面，改名為「公民與社會發展科」，在課程不同主題加入「國家」元素，而公開試成績將只設達標與不達標，變相減低該科目的重要性。
教師除了要教國安教育，在校內的一舉一動也飽受政治壓力，不少人遭學生、家長、同事甚至校外人士匿名投訴，被舉報的教師往往無法得知投訴的實際內容和字眼，卻要向局方證明自己清白。
教育局截至4月底接獲與社會動亂相關的269宗專業失德投訴，已取消3名教師注冊，並向151名教師發出譴責信、警告信、勸喻信或口頭勸喻。多名教師對德國之聲表示授課時會自我審查，並要提防學生錄音，甚至為了自保而退出WhatsApp的師生群組，直言師生間的信任已被徹底破壞。
香港教協5月發布一項調查，發現近1200名幼稚園、中小學的受訪教師及校長當中，有四成表示有意離開教育界，近兩成有意辭職或提早退休，他們稱「政治壓力日增」。被問及何時會有實際行動時，11.3％表示已經或將會於本學年期間或結束時離職。
高等教育界也不能獨善其身。香港民意研究所今年5月發表的調查發現，近六成人認為《國安法》對學術自由的限制大，45%人認為大學管理層並無努力保障學術自由。而全球公共政策研究所（Global Public Policy Institute）在3月公布的「全球學術自由指數」，香港評分大幅下跌，僅獲評Ｄ級，排名在柬埔寨之後，報告作者歸咎於《國安法》令高等學府面臨壓力大增。
美國《大西洋》雜誌今年報導指，港大有一名研究生舉報至少兩名教授涉嫌觸犯《國安法》，多名教授在閉門會議上表示「失望、恐慌」。
文化：進入禁書、禁片時代
香港曾有「禁書天堂」之稱，但在《國安法》實施後，不僅有關中國官場的「政治禁書」絕跡，連香港本土的書籍也被下架。
香港公共圖書館分別在去年7月及今年5月，抽起多本書籍，包括前香港眾志秘書長黃之鋒的《我不是英雄》及《我不是細路 : 十八前後》，前立法會議員陳淑莊的《邊走邊吃邊抗爭》，嶺南大學中文系前助理教授陳雲的《香港城邦論》、《香港保衞戰》、《香港遺民論》等，旅美作家余杰的《卑賤的中國人》和《納粹中國》，流亡作家廖亦武的《這個帝國必須分裂》，港大學苑的《香港民族論》，前立法會議員何俊仁的《我向霸權宣戰》，時事評論員林匡正的《香港公民抗爭運動史－挫敗的三十年剖析》、《香港公民抗爭運動史2 中港對決》等等。
