被譽為民進黨「頭號軍師」的邱義仁，7月4日應前總統陳水扁之邀赴微微笑廣播電台上「有夢上水」節目，接受前老板訪問。訪問中兩人談了不少「國家機秘」，包括2004年「兩顆子彈」事件時，擔任總統府秘書長的邱義仁在記者會為何展露「神秘微笑」，還有2008年讓邱義仁陷入司法風波的巴紐案、安亞案等內情。
不過，兩人對話中最令人關注的是民進黨台獨黨綱存廢、台獨主張能否實現，以及另一個影響深遠的議題：從黨外到民進黨40年來的議會與街頭路線之爭、體制內與體制外的不同運動策略。
這兩個議題都對民進黨路線影響最深遠。「台獨黨鋼」是北京拿來定性定調民進黨的「罪證」，而民進黨的路線問題至今仍影響著台灣社會改革與公民社會發展。邱義仁在這兩件重要歷史議題中都是主角。
阿扁操作台獨神主牌
「台獨黨綱」是邱義仁的老戰友、新潮流系大老林濁水於1991年民進黨第五屆全國黨員代表大會第一次會議中提出並獲通過的。這個條文的重點是，民進黨主張：一、台灣要獨立建國，制定新憲；二、重新界定台灣領域主權，進而重新界定兩岸關係：三、獨立建國以及頒行新憲法需要經過公投。
當時民進黨還沒有執政的能量，即使北京對民進黨台獨黨綱不滿，也不會出動軍機軍艦威嚇。到了1999年初，陳水扁有意競選總統，認為台獨黨綱一方面恐讓台灣選民懼怕，另一方面也會讓北京和華府疑慮，所以策動民視舉行一場「跨世紀國家走向系列辯論會」，沈富雄與郭正亮代表主張修台獨黨綱的辯方，而林濁水與邱義仁則在辯論中反對修改台獨黨綱。邱義仁接受阿扁訪問後，林濁水在臉書上說：「事實上哪裏是沈富雄、郭正亮主張廢除台獨黨綱而已，根本是陳水扁叫他們嗆聲要廢的。」
林濁水這位「台獨理論大師」還諷刺阿扁：「他從廢台獨轉到台獨衝衝衝，衝得美國火冒三丈，卸任後又組一邊一國連線繼續衝衝衝，最後才回歸台獨黨綱並加上最近講的這一套。」
對林濁水與邱義仁而言，民進黨的台獨黨綱代表著一種夢想，是民進黨要去推動的理想。但邱義仁一向務實，很清楚國際現實不利於這個夢想的實現，他說「推動」台獨不代表「宣布」台獨，不只宣布台獨中國會打台灣，美國根本也不贊成，邱義仁說，台獨「確實不是台灣人民可以自己決定的」。去年他參加美國喬治城大學線上研討會時也曾說：「台灣務實的政治人物不會這麼做，除非瘋了，哪怕連前總統陳水扁最後也會踩煞車。」，而他過去的老戰友林濁水則是個樂觀派，他說：「台灣不是國家一點也不是真理，只是國際政治呈現了他殘酷不仁的一面，但是世界並不會永遠殘酷不仁，一個人不必非要奉殘酷不仁為真理不可。」
