他絶望地搜遍了自己的鋪位和整列火車，還衝到華盛頓聯合車站的候車室、休息室、餐廳，試圖找到可以的乘客，結果徒勞。極度沮喪的惠勒別無選擇，只能向原子能聯合委員會報告文件失蹤。委員會三名成員立刻趕到火車站一起搜尋，同樣沒有結果。
最終，中午過後不久，JCAE 負責人博登（William Borden）不得不接受現實，拿起電話撥通了聯邦調查局（ FBI） 華盛頓辦事處。
FBI 未能破案
在隨後的五個星期內，負責此案調查的特工萊昂斯（Charles Lyons）得以確定並排除了五名嫌疑人，他們曾和惠勒乘坐同一列費城--華盛頓特區的火車，且鋪位與惠勒相鄰。
但他了解的情況仍存在一些令人擔憂的空白。
首先，萊昂斯沒能找到一對 30 - 40 歲「外表普通、衣著樸素"的夫婦和他們的孩子；他們在最後一刻從售票員那裡買了車票，佔據了上下鋪位。
更奇怪的是萊昂斯也沒找到惠勒斜對面的 8 號下鋪的乘客。
萊昂斯有這個人的票——最後一分鐘的票，在費城車站售票窗口買的——但令人沮喪的是，儘管在芝加哥的 FBI 實驗室仔細查看，持票人在鐵路公司座位表上的名字還是無法辨認。
這個神秘的男人，或女人，名字有點像 Magenbright、Wagenbright，或者 Wagenknight，但無法能確定究竟是哪一個。
氫彈文件上寫了什麼？
即使到了今天，惠勒那天晚上在火車臥鋪上看到的內容仍舊屬於高度機密。不過，我們可以通過惠勒接受FBI問訊記錄中窺得一斑。
這份文件證實，美國的熱核武器研發正在走向成功（它已於 1952 年 11 月測試了一個粗糙且現成的原型，代號為"常春藤邁克"）。它還透露，有幾種熱核武器被認為可付諸實際運用。
惠勒告訴調查人員，這份絶密文件還透露了有關製造「超級」聚變炸彈的技術細節——「鋰 6 很有用，壓縮很有用，輻射加熱提供了一種獲得這種壓縮的方法」 。
這位物理學家認為，提到鋰 6 作為一種重要成分會引起克里姆林宮的興趣。不過，他告訴聯邦調查局調查人員，「輻射內爆的定性概念……是最重要的發現」——對於蘇聯原子科學家來說這可能是至關重要的信息。
惠勒對正式文件粗心大意是有前科的，記錄在檔，不過沒有人真的相信他是蘇聯間諜。
特工萊昂斯經手調查此案。他首先查清 1 月 7 日上午所有蘇聯外交人員的動向，然後開始調查跟惠勒搭乘同一列火車前往首都的他所稱的「激進派代表團」。這些人是去白宮門前集會示威的，他們凖備舉著標語牌，敦促總統下令赦免羅森伯格夫婦的死刑。
