國防部長嚴德發日前在立法院答覆立委質詢時表態，國軍不會為台獨而戰。總統府秘書長陳菊今（17）被問及此說，她表示，國家的國防部長必須捍衛台灣安全，個人的政治主張應給予尊重，但「國防部長有責任捍衛台灣的國家安全。」
陳菊上午陪同蔡英文出席國家人權博物館綠島園區揭牌儀式，下午轉往台東「石山木」工坊參訪原住民部落，晚間則與隨團媒體茶敘，會中受訪做出以上表示。
據傳中國已著手蒐集「台獨名單」，媒體也問及陳菊看法。她則說，她不知道也尚未了解這部分；但她也強調，台灣發展有很多複雜的歷史因素，大家應多寬容，對於不同政治立場，現階段都期待更多對話、和解，對於彼此立場的尊重。
陳菊並表示，蔡英文總統必須捍衛、保護台灣主權，其兩岸關係立場從就職典禮上說得非常清楚，就是根據中華民國憲法、兩岸人民關係條例。蔡總統也不做任何挑釁，其立場從就職至今，從未改變。
對於台北市長柯文哲稱賴清德所謂「務實台獨工作者」是不負責任的說法、今又提及閣揆、總統在兩岸意見不同「怪怪的」，陳菊表示，她參與台灣政治超過48年，歷經不同階段，她對於公共事務者很少「指三道四」，尊重每一個人努力，很少做不必要的批評。
因此，陳菊強調，她對於柯市長任何言論，「沒有評論」。但她認為，賴院長在兩岸關係上，完全尊重總統的職權，其所要表達的內涵，跟蔡總統的主張沒有差異；賴當時只是在答覆立委質詢時，提及台灣前途決議文，兩人立場一致，這一點非常清楚。
