其實話說回來，「賣官鬻爵」這種事情，在清朝後期其實已經非常常見，甚至從康熙年間開始，就是被官方默許的。
所以，這也並非是珍妃命運轉向的真正原因。
那究竟是什麼原因？關鍵還是珍妃的涉政，而且是深度涉政—影響光緒帝，試圖推翻慈禧。
珍妃被「廷杖」和降為「貴人」是在1894年，請注意這個年份，是中國在「中日甲午戰爭」中慘敗的這一年。
中日甲午戰爭一戰，很多人以為罪在慈禧，但事實上，慈禧那時候已經「歸政」光緒。當然，實權雖然依然掌握在幕後的老佛爺手裡，但甲午戰爭，站在前臺指揮的一直是光緒帝自己。
在這場改變中日兩個國家國運的戰爭中，以光緒帝為代表的「帝黨」是堅決主戰的，而以慈禧為代表的「后黨」其實是主和的。當然，不能說當時以大清帝國之威（自我評估），主戰有什麼不對，但至少當時，「帝黨」和「后黨」之間的對立已經比較明顯。
在這個過程中，珍妃毫無疑問是站在光緒一邊的。而且她憑藉自己的影響，試圖一舉逆轉皇帝對太后長久以來的劣勢。比如，珍妃的啟蒙老師文廷式，以及他的堂兄志銳（當時的禮部侍郎），借機參奏李鴻章求和賣國，惹惱了這位晚清第一權臣。李鴻章馬上反參「文廷式企圖支持珍妃奪嫡，取代隆裕皇后；反對
慈禧聽政，支持光緒皇帝自主朝綱」。
結果果然激怒了正愁沒把柄的慈禧：文廷式被驅逐出宮，永不錄用；志銳被貶，放官邊疆（蒙古）。至於珍妃，自然是又打又降—不敢對皇帝怎樣，但用你的寵妃震懾一下你，我還不敢嗎？
但這個時候，慈禧和珍妃的婆媳關係畢竟還沒有惡劣到不可收拾的地步。第二年，珍妃和瑾妃又恢復了「妃」的位分。
真正的問題出在1898年—這一年，發生了「戊戌變法」。
這一針給病入膏肓的大清強行注入的雞血，徹底讓慈禧和光緒這對母子翻了臉。尤其是「帝黨」試圖包圍頤和園的「圍園殺后」行動敗露（袁世凱對告密此事亦有貢獻），讓慈禧徹底寒了心—可以說，自那以後，慈禧對光緒已不再抱希望。
辛辛苦苦養大的孩子，怎麼會變成這樣？當媽媽的慈禧肯定也經過無數個輾轉反側之夜，找過很多原因。而其中一個重要原因，自然會歸到珍妃頭上：我花了20多年讓他接受聖賢教育，你分分鐘就給他洗腦了？
於是，「戊戌變法」失敗後，珍妃再次遭罰廷杖，而且這一次，她被打入鐘粹宮後的北三所—一個當媽的，兒子都不要了，還會心疼兒媳婦？
據《故宮通覽》（紫禁城出版社，2005年）的介紹，珍妃被囚禁的那個小院，位於紫禁城最北，原來是明代宮廷奶媽養老居留的地方。珍妃入住後，正門被牢牢關上，打上內務府的十字封條，珍妃住在北房三間最西頭的一間，屋門從外面反鎖著，吃飯、洗臉等均由下人從一扇活窗中端進遞出。
