原田也著手調整分店的經營型態。麥當勞的分店可分成直營店與加盟連鎖店兩種，在過去藤田時代，直營店約占7成，加盟連鎖店約3成。加盟連鎖店以擁有數家小規模店面的加盟者為核心，相較於直營店，競爭力較強。原田因此判斷，直營店數若過多，將會拖垮整體企業的戰鬥力，因此他開始著手改組直營店的配置。
雖然最終日本麥當勞直營店減少至三成、加盟連鎖店則增加為七成，但在調整過程中，不論直營店或連鎖加盟店，營收欠佳的店面紛紛倒閉，因此實際上全國總分店數已慢慢減少。
從圖表3可得知，自從原田2004年出任執行長、逐步調漲商品單價以來，日本麥當勞全國營業額在六年內（統計至2009年為止）成長為原來（2003年）的1.4倍。從整體營業額來看，該公司的業績確實成長了，但平心而論，6年才增加為原來的1.4倍，平均每年成長不過23％左右（1.4÷6≒0.23），偏偏多數媒體都以此為報導核心，一般人也就跟著讚嘆了起來，這也是缺乏資料判讀能力的惡果。
壓垮日本麥當勞的最後一根稻草
簡單來說，原田魔法的具體內容，便是著重於「調漲價格」與「店鋪重整」這兩件事。原田之所以被讚譽為擁有經營魔法，是因為日本麥當勞在他的帶領之下，全國營業額大幅成長，但該公司獲利增加的真相，並不是直營店的收入變多，而是因為原田積極拓展加盟連鎖店的數量，促使加盟金增加所致。這並不是什麼不可思議的經營之道，不過是因為原田懂得判讀各分店的財務報表，並使獲利與虧損店鋪的占比達到最適化罷了。
再補充一點，儘管原田的經營策略一開始效果很好，但到了2012年左右便漸漸走下坡。實際上，壓垮日本麥當勞的並不只2014年的食安問題而已，該公司各高層如今紛紛急著出脫股票、換取現金，經營虧損金額更逼近400億日圓，與過去的盛況完全無法同日而語。
日本麥當勞究竟出了什麼問題？食安風暴後全國民眾的自主抵制，其實只是壓垮駱駝的最後一根稻草。追根究柢，正是因為該公司先前太愛降價促銷，在原田上任、決定調漲商品價格後，開始讓消費者有了「麥當勞並沒有想像中便宜」的印象，漸漸不再上門的緣故。
麥當勞與摩斯漢堡根本不是同業，怎麼比？
當日本麥當勞業績變差，對原田的評價也跟著改變，外界開始出現尖銳的批評；新聞媒體及各大網路平台，也經常將競爭對手摩斯漢堡拿來比較，不斷稱讚後者的經營多麼優秀，並暗指麥當勞的失敗是因原田的種種誤判所致。
摩斯漢堡持續、穩定的獲利（儘管整體營易額仍是衰退的），其實也和原田魔法一樣，不過是一種集體迷思罷了。若真的逐項比較分析，就可看出其中的端倪。
