古中醫書說:『萬病歸脾土，醫病先醫腸』。有健康的腸道就會有健康的肝臟和腎臟，頭腦和免疫系統也會更清晰與強健。相對的，腸道若壞菌太多，產生大量毒素，引發腸壁發炎造成腸漏症，導致毒素進入血液中，肝臟和腎臟的解毒負擔會加大，也會造成發炎。林教授進一步說明:「腸道乾淨是很重要的，腸道主宰70%的免疫系統，有健康的腸道，很多疾病就會遠離我們，甚至突然消失。像全身慢性發炎和過敏反應等現象都會減少，血清素也會正常分泌，睡眠品質自然好，自律神經也會正常化。」
林文鑫教授及其醫藥團隊研究顯示：「在人體臨床實驗中發現，腸道中壞菌數量常常是好菌的10~1000倍。所以一般人的腸道中，其實壞菌是絕對優勢的，這些壞菌最大宗的就是大腸桿菌群，會產生大量的發炎性內毒素來傷害我們的腸道組織，所以大部分人的腸道都處於慢性發炎的狀態。實驗發現要改變腸道菌群最快速也最有效的方法，就是直接投入高劑量，而且可有效殺菌和定殖能力的益生菌。」
台灣益生菌之光！中國醫藥大學國際專利益生菌CMU995 腸道健康守門員
中國醫藥大學的國際專利菌CMU995，是從3萬多株來自健康寶寶的益生菌中脫穎而出，對於人體腸道和體質具有明顯的助益，因此獲得10張以上國際發明專利，和經濟部頒發創新研究獎。
中國醫藥大學醫藥團隊經過嚴格的實驗篩選發現，CMU995益生菌可強力吸附在消化道和泌尿道上皮細胞，同時也會分泌出很多殺菌素來打擊壞菌。非常適合有常常腹瀉、腸躁症、便秘、消化不良、脹氣，或胃食道逆流、胃潰瘍等症狀的民眾，另外，對於腸胃道或是泌尿道常常反覆遭受細菌感染的人，也有相當明顯的幫助。幽門桿菌是引發胃癌和消化道潰瘍的主要元兇之一，實驗顯示CMU995可以抑制幽門桿菌感染，降低腸道毒素。
除了CMU995益生菌，林教授實驗室也針對精神方面進行菌種開發，從母乳中篩選出可幫助腸道分泌血清素的益生菌，同時也會幫助血液中多巴胺濃度正常化，這兩株母乳益生菌實驗編號為IQ180和Happy99。主要可以改善失眠，或是精神憂鬱的朋友，更特別的是也可以用來預防失智，或提升孩子的智力和學習發展。
疫情期間，很多醫學研究期刊提出：『益生菌有對抗新冠病毒或流感病毒的潛力』。林教授也說明這是很有科學論述的。林教授團隊就發現，實驗篩選出的BB1、BB5益生菌，就特別有效在於免疫力提升，這兩株菌進入人體腸道後，會透過派亞氏淋巴腺體來活化全身的免疫系統，同時提升肺臟中免疫細胞去清除細菌和病毒的能力。此外這兩株菌也能透過活化調節性T細胞去調控過敏發炎細胞。這是林文鑫教授團隊和兒童醫院共同研發的特殊免疫菌種，研究成果已投稿到國際免疫藥理學期刊。實際應用效果也很令人滿意，而且安全無藥物副作用，這個研究成果對過敏的大小朋友來說是一大福音。
欲了解更多中國醫藥大學林文鑫教授團隊益生菌的研究成果，都可上網搜尋或醫學相關網站查詢。
