《所得稅法》股利分離課稅新制，不僅大幅降低企業主捐款節稅的動機，還進一步導致公私立學校募款條件差距，進一步擴大。
企業捐款給公立、私立學校 不一樣在哪裡？
根據《私校法》規定，納稅義務人透過教育部「興學基金會」之捐贈，可享「所得總額」50%的租稅抵減，「未指定特定之學校法人或學校者之公益捐贈，得全數扣除」，但《所得稅法》同時規定，納稅義務人對政府（含公立學校）之捐獻，其「捐贈扣除額」之上限，不受金額之限制，由於企業主捐贈給公立學校等政府機關，最高可享100%之租稅抵減，多數企業主基於節稅考量，寧可把錢捐給公立學校。
智榮基金會的副執行長林信昌表示，施振榮家族過去長期以來，都會捐款給交通大學、彰化中學等公立學校，依據《所得稅法》規定，這部分的捐款視同對政府捐款，可以全額抵稅，但對於私立學校、財團法人之捐款，「捐贈扣除額」的上限只有20%，這項規定無形之中，造成了這些教育與公益團體的募資困難。
同歸文化部管轄 捐錢給國藝會和公視基金會也有差！
以同樣是文化部管轄的國家文化藝術基金會（國藝會）與公視基金會為例，根據《國藝會設置條例》，捐款國藝會「視同捐贈政府」，於所得稅中享有全數列舉扣抵或認列費用的賦稅優惠，且不受金額的限制；相對之下，民間企業主對公視基金會，卻因為公視基金會在法律上，被視為「財團法人」，並非政府機構，因此，企業主對公視的捐款，最高只能享20%的抵稅。
葉紫華表示，公共電視成立以來，始終仰賴對外募款，但從企業主的角度，捐款給國藝會的節稅效果，卻遠高於公共電視，這樣的規定不利於公視長期的財務健全，「施振榮擔任國藝會董事長，一直告訴文化部長鄭麗君，20%的規定一定要修改！」
財政部官員：企業主從事公益慈善，並不是為了政府租稅補貼才捐款
財政部官員強調，企業主從事公益慈善，並不是為了政府租稅補貼才捐款，站在政府的立場，就算鼓勵公益慈善捐款，也不可能毫無限度地提供租稅抵減，台灣的公益慈善團體成千上萬，但其中不乏「假公益之名，行避稅之實」的團體，財政部不可能因為「股利分離課稅」新制上路，降低企業主捐款意願，就額外提供股利所得的「捐贈扣除額」。
