「畜牧業廢水排到河川，是錯置資源，政府希望透過政策補貼，鼓勵養豬業糞尿經過厭氧發酵產生沼氣發電，剩下的液體與固體，能夠作為農地肥分使用」，魏文宜說。
魏表示，目前全國養豬戶有37場大型養豬場，已向農政單位提出沼渣沼液轉作農地肥分使用計畫，環保署希望以這37場作為種子，推廣豬糞尿資源化，但有鑒於全台飼養頭數在200頭以下養豬戶，高達3375戶，佔整體養豬戶45%，為讓小型養豬場能夠集中處理廢水，農委會在雲林褒忠與屏東九如，正在興建污水共同處理廠，但尚未開始運作。
今年7月將正式開徵，豬農每頭豬每年必須繳納40元的水污費，配合畜牧業水污費開徵，農委會與環保署也加碼豬糞尿沼氣發電設備補助，以目前全台養豬544萬2000頭計算，不過，畜牧業水污費開徵，勢必將帶動養豬業成本的增加。
水污費按豬隻頭數計算 農委會盼杜絕偷排污水
農委會官員表示，養豬業每頭豬課徵40元水污費的政策，2年前在《水污染防治費收費辦法》修法後即已確立，現在2年的調適期到期，環保署也同意沼渣沼液，可以轉做農地肥分，豬農可以選擇將厭氧發酵後的廢水拉管排放，或是選擇沼渣沼液資源再利用，加上水污費上路初期給予6折的漸進式費率，「7月份開徵，到目前為止，還沒有聽到豬農醞釀反彈」，官員分析，豬價目前相對較好，是豬農對水污費政策較能接受的主因。
官員表示，從豬農角度，將廢水直接排放到地面水體，當然是成本最低的作法，但這樣的作法只是把成本轉嫁給社會大眾，讓民眾承擔污染後果，水污費的開徵就是透過政策，鼓勵農業廢棄物資源化再利用，若因此導致養豬成本增加，也是值得的投資。
對於水污費今年上路以來，彰化二林、屏東萬丹、九如等地，仍然陸續發生養豬戶趁連假或深夜偷排廢水的情形，農委會官員強調，目前水污費徵收方式，不是在養豬場外掛掛水表，計算廢水排放量，而是以養豬頭數計算應繳的水污費，「不會因為偷排，水污費就少算」，各縣市環保局針對廢水偷排，已加強取締，《水污法》修法後偷排、繞排廢水罰款，也大幅調高為20-2000萬元，豬農應該有所警惕。
