中國全國人大常委會28至30日召開第20次會議，先前公開議程未見受到關注的《香港國安法》，不過6月30日傳出全國人大常委會全票通過該法，即日加入香港《基本法》附件三，將於7月1日香港主權移交周年正式生效，對此我國外交部6月30日表示，此舉嚴重危害香港「高度自治」原則，予以強烈譴責。
我國外長吳釗燮也推文稱：「中國人大常委會通過的《香港國安法》嚴重違反香港主權移交前的承諾，也破壞香港自由及基本權利。我們加入國際社群譴責此舉，且香港人若有需要，將會持續提供協助。」中國全國人大5月28日批准啟動立法程序，常委會委員長會議提請6月18日召開的第19次常委會審議草案。
#NationalSecurityLegislation adopted by #China's NPC is a serious violation of what Beijing promised #HongKong before handover. It's also a blow to HK's freedom & basic rights. We join the international community in condemning the move & will keep helping #HongKongers in need. JW
— 外交部 Ministry of Foreign Affairs, ROC (Taiwan) (@MOFA_Taiwan) June 30, 2020
根據草案，分裂國家、顛覆國家政權、恐怖活動、勾結外國或境外勢力4種行為被視為危害國家安全。中國全國人大常委會第20次會議6月30日結束，以162票全數贊成通過《香港國安法》，並將於7月1日正式生效；我國外交部痛批，此法大幅限縮香港言論自由和司法獨立、摧毀自治與法治，更衝擊區域和平。
外交部呼籲，中國政府應尊重香港人民追求自由與人權，「唯有正視香港人民訴求，具體落實對香港自由民主的嚴肅承諾，真誠開啟社會對話，才是解決問題，獲得人民信任和國際尊重的根本之道」。對於中國違背香港「50年不變」承諾，且危害香港「高度自治」原則，外交部表達嚴厲譴責。
外交部強調，面對香港情勢，台灣有責任與國際間理念相近夥伴合作，一起守護香港的自由，我國會密切注意《香港國安法》實施情形及中國政府後續作為，並強化與理念相近國家意見交流，根據情勢適時妥善應變。此外，我國「香港人道援助關懷行動專案」已正式啟動，以落實我國對香港人的支持及協助。
