強生政府面臨的另一個重大挑戰是「統獨」問題。脫歐和新冠疫情造成英國內部獨立自主的聲浪水漲船高，英國脫歐結果可能刺激蘇格蘭、威爾斯及北愛爾蘭政府要求更多權力。親歐的蘇格蘭在英國脫歐後虎視眈眈，想藉機獨立。蘇格蘭民族主義者表示，他們並沒有脫歐想法，如今可能嘗試獨立後，再重新加入歐盟。蘇格蘭民族黨領袖、蘇格蘭自治政府首席部長斯特金（Nicola Sturgeon）即宣布，在明（2021）年的議會選舉中，要努力爭取蘇格蘭獨立。2014年蘇格蘭獨立公投受挫，但過去幾個月當中，不同民調均顯示，蘇格蘭獨立已獲得過半數的支持。另許多蘇格蘭選民認為，愛丁堡在應對新冠疫情的表現，遠遠優於倫敦。另目前新冠病毒在英國出現傳播速度更快的新變種病毒株，可能比舊病毒株增加70％感染率。
英國脫歐後，歐盟仍是英國最大貿易夥伴之一。但脫歐使歐盟失去英國提供的預算支出，使歐盟每年預算缺口將達120億至150億美元、整體經濟損失將達0.38％。而脫歐是否會對歐洲整合造成巨大衝擊？這是現在外界關注的一個重點。我認為，歐盟成員已做好心理準備。實際上，英國和歐陸之間本就有心結，即使英國留在歐盟也是同床異夢。記得當年法國總統戴高樂（Charles de Gaulle）建構「從大西洋到烏拉山」（from the Atlantic to Urals）的歐洲國家體系時，就有排除英美在外的想法；換言之，戴高樂強調的歐洲整合是從法國利益考量，是以法、德2國的夥伴關係為基礎。
拜登和川普不同，他不贊成英國脫歐，曾形容強生在外表和個性上就像是川普的「複製」。拜登有愛爾蘭血統，多次強調支持1998年簽署的《耶穌受難日協議》（Good Friday Agreement）。這項受拜登重視的協議奠定北愛爾蘭和平，按其規定，英國統治的北愛爾蘭和隸屬歐盟的愛爾蘭之間的邊界，必須維持開放。拜登不欲見到愛爾蘭及英國之間存有崗哨邊界，因北愛即愛爾蘭是英國與歐盟之間唯一的陸路邊界。
拜登11月10目與英國首相強生通話時，表達希望強化與英國的特殊關係，並列出雙方須加強的領域包括：2021年英國將主辦「七大工業國」（G7）及聯合國氣候變遷會議（COP26）、氣候變遷、新冠病毒、全球衛生安全、永續性經濟復甦和加強民主等。
英國脫歐確實會對大西洋合作關係造成衝擊，這是拜登上任後將立即面臨的問題。過去英國留在歐盟時，最大的功能就是作為連接美歐關係的黏合劑。英國在脫歐後，還能繼續扮演這樣的角色嗎？
