馬英九曾為「顏清標條款」向全國致歉
不過，這次除罪僅及於行政機關，顯然不夠，因為還有民代、及以假發票報研究費的龐大教授群，於是二０一三年，立法院又通過修法案，在原來的九十九之一條中，增加一道「大尾巴」，「中華民國九十九年十二月三十一日以前各民意機關支用之研究費、公費助理費與加班費、業務費、出國之考察費、各鄉（鎮、市、區）公所支用之村（里）長事務補助費；中華民國一百零一年十二月三十一日以前各大專院校職員、學術研究機構研究人員支用政府機關補助之研究計畫費，其報支、經辦、核銷、支用及其他相關人員之財務責任均視為解除，不追究其行政及民事責任；如涉刑事責任者，不罰。但已報支不符法令之相關費用，應予繳回。」和一個「小但書」：「意圖為自己或第三人所有非關研究執行之財物，而報支政府機關補助之研究計畫費者，不適用前項規定。」（公款公用不能私用，比方教授拿研究費買自家冰箱等就不能除罪）
沒想到，這個三讀法案引爆眾怒，因為當時顏清標喝花酒却報支業務（特別）費，被民進黨痛批為「顏清標條款」，五天後，馬英九總統出面舉行記者會為修法不周向全國致歉，並同意行政院向立法院提請覆議，最後，這個修法案翻盤，不當報銷的顏清標貪汙罪定讞入獄，顏清標感慨，「此事並非由我開始，希望到我為止。」
民進黨反對「顏清標條款」，却痛斥國民黨反對「陳水扁條款」，其道理當然見仁見智，畢竟前第一夫人吳淑珍搜集的發票，包括貴婦團的星級飯店住宿一報就是三百萬，還有企業主送禮被換貨的價差，都以再報國務機要費，其情節實在超過「合情合理」的範圍。儘管國務機要費案還在更二審等不到開庭，但民進黨要以此為陳水扁解套，還是極具難度，畢竟陳水扁還有國泰併世華案（二次金改弊案）、教唆偽證案（南線專案）、陳敏薰涉買官洗錢案、侵占隱匿公文案未結，若要依法律程序尋求特赦，豈是一樁國務機要費案可了結？
有限除罪，不表示會計人員可以放任不當報銷
回到修法本身，民進黨立委關切「除罪」，但在第九十九之一條的除罪之外，關鍵還在第九十九條本體，「各機關主辦會計人員，對於不合法之會計程序或會計文書，應使之更正；不更正者，應拒絕之，並報告該機關主管長官。前項不合法之行為，由於該機關主管長官之命令者，應以書面聲明異議；如不接受時，應報告該機關之主管上級機關長官與其主辦會計人員或主計機關。不為前二項之異議及報告時，關於不合法行為之責任，主辦會計人員應連帶負之。」
簡單講，只要會計、審計人員有法律自覺，都不該縱容主官胡報特別費，更不能代為主管籌謀，隨便拿發票頂領特別費，若有不合法的報銷，應拒絕、還應書面聲明異議（留下證據）、若不為主官接受，那得向上級報告，從條文來看，台灣能發生幾可動搖國本的國務機要費案、特別費案、教授假發票案、民代亂報帳案…，只說明一件事：我們的會計、審計不是從根爛掉，就是從頭呆掉，他們正是「歷史共業」的關鍵共犯。
法律為政治服務，政治為民進黨服務，民進黨為陳水扁服務…，扁案像道揮之不去的陰影，纏繞台灣十五年，國會絕對多數的民進黨要通過九十九之一條修法案，動動小姆指即可，但是不能不提醒全國會計審計人員：第九十九條依舊在！就算除了民國九十六年之前的「罪」，不表示特別費、機要費從就可以漫天亂報，抗拒不了主官的胡鬧，就得負法律責任。
