花蓮近海3日上午發生7.2強震，日本氣象廳隨即針對沖繩本島及宮古島、八重山地區發布「海嘯警報」、隨後降級為「海嘯注意報」，並於沖繩縣的與那國島、石垣島、宮古島等地測得30公分海嘯。根據日本放送協會（NHK）中午的最新報導，日本氣象廳已經解除沖繩地區的「津波（海嘯）注意報」，目前日本方面並未傳出任何傷亡消息。
日本氣象廳在台北時間9時40分左右，變將沖繩地區的「海嘯警報」降級為「海嘯注意報」，呼籲接獲「海嘯注意報」的民眾遠離海岸、河口地帶。日本氣象廳將海嘯警報區分為3個等級，「海嘯注意報」為海嘯高度低於1公尺、「海嘯警報」為海嘯高度介於1公尺到3公尺間、海嘯高度3公尺以上就會發布「大海嘯警報」。
沖繩縣與那國島在台北時間上午8時18分，已經測得30公分海嘯。其他包括石垣島石垣港於台北時間上午9時42分，宮古島平良地區於台北時間9時50分也都分別測得20公分與30公分的海嘯。日本氣象廳在正午時分也解除了宮古島、八重山等地的「海嘯注意報」，等於完全解除了沖繩地區的海嘯警報。
NHK報導，這次花蓮7.2強震讓沖繩那霸機場一度取消所有航班、機場旅客被緊急安置或疏散，包括離島渡輪在內的航運線路也暫停運行。不過在海嘯警報解除、跑道也經過檢查確認安全後，那霸機場已於當地時間上午10時53分恢復運營。不過海嘯警報期間，全日空仍取消了往返那霸、新石垣和宮古機場的13個航班，部分航班也被迫返回出發機場或改變目的地，共計2630名旅客受到影響。成田機場表示，受到沖繩縣海嘯警報影響，截至上午10時30分，共有三架航班（兩架飛往那霸，一架飛往新石垣機場）決定折返。
日本國土交通省表示，截至當地時間上午10時30分，沖繩縣包括兒玉諸島、久米島和大東島在內的5條客運渡輪航線停航。沖繩高速公路自上午9時15分起，也緊急關閉了許田和那霸之間的全線交通。一位從沖繩縣與那國町前往石垣市看病的70多歲的老先生表示：「我從來沒碰過這麼劇烈的震動，我的手機發出海嘯警報的警告聲響。」石垣市的居民都被要求前往中央體育公園避難，這位老先生對NHK表示：「當時那裡聚集了很多人，人和車都被塞在街上。」
一位來自與那國町的漁民對NHK表示，他是在漁港工作時感覺到強烈搖晃，日本氣象廳發出海嘯警報後，漁港的災難廣播也隨即響起。他在地震過後前往地勢較高處避難，與那國町許多漁船也撤離到近海。受訪漁民表示對這次海嘯警報感到非常驚訝，「因為我已經很久沒有看到海嘯了」。NHK說與那國町3日上午發生了震度4級的地震，包括町內工作人員在內的上百位民眾被疏散到中學與小學校區，沖繩與宮古島的居民許多則撤離到臨時開放避難的飯店，飯店也對避難者發放飲水與其他民生物品。在海嘯警報徹底解除後，沖繩各地一度關閉的商店與超市也陸續恢復正常營業。
