在第三議題「生態維護」上，由於反對方學者無法出席，是以事先錄影方式播放，引發旁聽民眾認為會議應保留擇日再審，待學者出席後再進行討論，不過經過環評委員一致同意，認為已經獲得充分資訊後，會議應進入最後的閉門討論。
台電：會儘力爭取地方支持，供電義務不能等
但就在閉門會議階段，旁聽民眾不願離席，造成會議無法進行，環評委員提出進行投票，經現場逐一詢問委員意見，認為已經獲得充分資訊可供決定，才最終得出結果，支持兩案併呈的有9位委員，僅1位支持再進行一次專案小組審查，最終讓「支持同意開發」與「不支持開發」兩案併呈送環評大會審查，並交由大會處理及釐清相關疑慮。
會後台電董事長曾文生受訪表示，今天的會議有3大議題，從港務營運、操船安全、海洋生態等面向討論，專家學者也都就有疑慮的部分進行討論，台電也針對問題提出回答。
針對兩案併呈送大會的結果，曾文生說，會在大會時以委員還有疑慮的議題進行說明，爭取大會支持，希望協和的更新改建案早日通過。被問及是否有時程上的壓力？曾文生說，當然是越快開始做越好，畢竟穩定供電是台電的任務。
最終送環評大會一次定生死 環境部：會繼續保有民眾發言權力
會後突然出現的環境部長彭啟明受訪指出，這次會議有讓民眾充分支持，雖然正反兩方各持意見，但各界應珍惜雙方都有表達的平台，同時也支持後續在環評大會上，民眾有繼續表達意見的權力。
被問到後續送環評大會後，會如何處理相關案件，環境部說，依照議事規則，會有「同意開發」、「不同意開發」以及「退回專案小組審查」等三種可能，就看雙方如何爭取委員支持，環境部沒會有預設立場。台電必須要在4月底前再補足專家委員疑慮部分，後續再召開環評大會繼續審查。
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