恐龍蛋和鳥蛋在構造上的一致性，說明類似雞蛋那樣的羊膜卵，遠在鳥類出現之前恐龍就已採用了。也就是說，脊椎動物從海洋進軍到陸地時所需要的卵結構的改變，在爬行動物（包括恐龍）階段就已經完成了，鳥類只是繼續使用而已。從恐龍蛋變為鳥蛋，並沒有結構上的障礙需要跨越，所以現在鳥和鳥蛋的問題就變為：是恐龍先變成鳥，再產出鳥蛋，還是恐龍先產下鳥蛋，再孵化出鳥？要回答這個問題，就需要了解生物繁殖的過程和物種演化的機制。
大家都知道：生物的性狀是由遺傳物質，即去氧核醣核酸（DNA）所決定，「種瓜得瓜，種豆得豆」，就是因為瓜和豆的DNA不同。現代的動物複製技術，可以僅從一滴鼠血（血中白血球的DNA）誕生出複製鼠，說明DNA是決定生物性狀的關鍵物質。從恐龍到鳥的變化，也一定是由於DNA序列的改變，問題就是這個改變在什麼階段發生、在什麼細胞裡發生，以及這些改變對下一代的影響。
每個生物體，特別是像脊椎動物（包括魚類、兩棲類、爬蟲類、鳥類和哺乳類動物）這樣極度複雜，而且壽命較長（多以年計）生物的一生中，身體由於受到內部因素（如活性氧）和外部因素（如宇宙射線）持續不斷的攻擊，以及細胞分裂時DNA複製錯誤等原因，總會有一些細胞裡的DNA序列會突變。所以隨著年齡增長，身體一些細胞的DNA就不再和受精卵階段的DNA相同。
和其他脊椎動物一樣，恐龍身體裡面也有兩類細胞。一類是構成身體的體細胞，比如組成心臟、肝臟、大腦、皮膚的細胞都是體細胞，它們占身體細胞的絕大部分，具體執行各種生命活動；另一類是生殖細胞，它們的任務是繁殖下一代，和身體其他部分的生理功能無關。這兩類細胞裡面的DNA都會突變，但體細胞裡的突變和生殖細胞裡的突變，結果完全不同。
體細胞中DNA突變是零星和隨機的，不同體細胞裡面DNA突變的情形彼此不同，所以沒有全身一致、統一的DNA序列改變，也不會有某個基因在全身所有細胞都突變。一個體細胞裡的DNA突變，不能使相鄰體細胞裡的DNA發生相同突變，即某個體細胞DNA的突變不能「擴散」到其他體細胞，因而「彼此隔絕」；而物種的改變需要相關組織中所有細胞的DNA都發生同樣變化，體細胞的零星突變不可能辦到。總體平均起來，生物體一生中細胞裡的DNA還是和受精卵的DNA極度一致，也就是不變。從成年動物身上取下的細胞可以複製出這個動物（即從這個細胞發育出的動物和當初從受精卵發育而來的動物相同）就可以證明這一點。所以某隻恐龍從蛋孵化出來後，終身只能是恐龍，不會因為這隻恐龍的體細胞DNA零星和隨機的突變就變成一隻鳥。
