京都有很多寺廟與神社，有些是家喻戶曉的神社，如本書介紹過的世界文化遺產上賀茂神社和下鴨神社，有些是少數在地京都人才知道的小眾神社，如果細究街角的小祠、攝社和末社，神社的總數量是數也數不盡的。
想當然每間神社祭拜的神明都不同，從神話中出現的名字很長的神，到菅原道真這種比較熟悉的人物都會是祭拜的對象。每間神社的建立各有起因，為了鎮魂而建造的神社，可能流傳著鎮魂相關的事件與傳說，有時候深究下去，就會找出一個歷史碎片，我接下來會介紹幾間這一類的神社。
御靈神社：祭拜慘死弟弟冤魂
「御靈神社」顧名思義就是間鎮魂的神社，位於烏丸鞍馬口附近，這也是應仁之亂爆發的地點。在定都平安京後，為了平息慘死的弟弟早良親王的冤魂，桓武天皇決定祭拜他的亡魂，於是才有了御靈神社。御靈神社後來合祀了六個化作怨靈帶來災難的亡魂，直到現在。
在那個時代，人民相信世間只要有災難，就一定是出於誰的怨念，因此會建造神社鎮魂。而且不只是人類，京都這個地方會祭拜任何帶來災難的魂魄藉此鎮魂，即便是石頭也一樣。
岩上神社：怨靈附身巨石
西陣有一間小祠「岩上神社」，小到會讓人錯愕的地步，手水舍上掛著「岩神」的匾額，裡面的祠堂有一顆巨石坐鎮。據說這顆巨石原本在堀川二條附近，而一統天下的德川家康在建造二條城時以擋路為由，將巨石搬遷到岩上通六角通以南那一帶，也就是現在的「中山神社」。接下來，巨石又被搬到中和門院（一五七五〜一六三〇）宅邸的池畔。畢竟是一顆很大的石頭，搬過去應該是庭園造景需要吧，沒想到這塊巨石竟然不是普通的石頭。巨石入夜會變成小孩的模樣，喊著想回到原本的地方，一下啜泣，一下惡作劇，許多女官都很忌諱，於是找了熟識的僧侶商量。
僧侶說巨石上有怨靈附身，因此帶走巨石，在當地建立「有乳山岩上寺」祭拜石頭。一如寺名所示，這裡信奉哺乳之神，也是很多女性的重要信仰，可惜在天明大火時付之一炬。寺廟付之一炬了，巨石依然存在，到了後世，經熱心人士之手，才給了巨石一間神社。認為一塊石頭也有靈魂，為了鎮住祂還信奉祂為神，這就是京都人的作風。京都有許多神社也可以說是歷史上的必然吧。
命婦稻荷社：前妻斬斷孽緣
烏丸五條附近的小巷子裡有一間很小的祠堂「命婦稻荷社」，旁邊有一口叫「鐵輪社」的井，這個神社流傳一個「丑時參拜」的詛咒儀式。
《鐵輪》是能劇的劇目， 因此可能有人已經聽過了，劇中有一個住在這附近的女人，她為了報復捨棄自己、迎娶續絃的丈夫，不惜跋山涉水，每晚都到「貴船神社」進行丑時參拜。另一方面，這個女人的前夫每晚都會做惡夢，於是他找安倍晴明（九二一〜一〇〇五）商量，晴明認為原因出在前妻進行的丑時參拜，並告訴他，要是繼續下去，夫妻兩人都會在今晚因為她的詛咒喪命。可想而知，前夫請求晴明，要他無論如何都要救他們一命，晴明無可奈何造訪了前夫家，設置祈禱棚，放上這對夫妻的替身，拚命祈禱，希望替身能代為承受這個詛咒。
