不過，離島工業區改種綠電的計畫，雲林縣政府方面並不支持，雲林縣政府官員表示，針對經濟部對外公告新興區東二區招租案，雲林縣政府曾經發函經濟部，請經濟部重新考慮。
地方不支持改種綠電 雲林縣官員盼優先引進產業
雲林縣建設局官員強調，雲林海線地區人口外移非常嚴重，站在繁榮地方的角度，離島工業區應該優先引進產業進駐，新興區自始自終都沒有辦理產業園區招商，經濟部方面應該先辦理招商，確定沒有廠商願意進駐後，再評估其他利用計畫，「新興區未來租給太陽能與風電業者，頂多只能創造50位左右的就業，對雲林海線發展基本上沒有幫助，根本無法帶動當地就業人口的增加！」
至於《電業法》規定1度電0.0012元的回饋金，對雲林縣財政來說，也是杯水車薪，雲林縣官員表示，根據雲林縣的財務試算，283公頃新興區未來租給綠電業者之後，綠電業者每年提供給雲林縣的「回饋」，1年不到100萬元，「台西鄉1年分到20萬元，雲林縣政府收到了地價稅、回饋金，也只有21萬元！」
據了解，根據「雲林離島式基礎工業區新興區東二區土地出租公告」，新興區工業區土地標租底價，海地部分每坪730元，土地部分每坪1萬1610元，雲林縣政府初步估算，工業局未來每年的租金收入有1.1億元，但由於新興區當初填海造陸成本高達上百億元，在工業區開發成本尚未收回以前，雲林縣政府根本分不到一毛錢。
根據經濟部作業基金基金預算，工業局下轄的「產業園區開發管理基金」，自扁政府以來，委託榮民工程推動的工業區開發案，虧損情況嚴重，工業局自2015年起，分3年向榮工購回離島工業區、台南科技工業區、彰濱工業區鹿港區、花蓮和平及斗六擴大工業區土地，3年合計舉借金額高達266億元，其中，新興區部分舉借金額就達106億元，購回新興區後，工業局每年的利息負擔高達上億元，「未來綠電業者每年支付1.1億元租金，根本只夠支付利息錢，最快100年後才可以損益平衡！」雲林縣官員表示。
雲林縣官員表示，今年台商回台投資，帶動全台工業區地價上漲，經濟部方面為了協助廠商回台投資，盤點了台糖2、3000公頃的農地作為儲備用地，離島工業區新興區有現成的283公頃土地，當初花了上百億元填海造陸，高雄氣爆事件之後，雲林的離島工業園區，始終是經濟部規劃離島石化專區的首要選項，如今工業局竟然主動放棄新興區以及四湖工業港的後續開發案，對照其他中南部縣市如火如荼的工業區開發案，經濟部對離島工業區的開發，頗有「始亂終棄」的味道。
