大臣大難不死向斐迪南告狀 引爆歐洲「三十年戰爭」
沒想到被丟出窗外的三人正好摔在堆肥裡，竟撿回一條命，除了受到驚嚇、暈倒外，沒有太大傷害。三人隨即向國王斐迪南報告波希米亞人造反。波希米亞起義軍也同時進入奧地利王國境內，兵臨維也納城下，斐迪南二世逼於形勢，在表面上假意答應進行談判，實際上在暗地裡向天主教同盟求助，最後將起義軍逼退回波希米亞境內。
然而，波希米亞王國推舉出腓特烈五世為國王，讓斐迪南二世忍無可忍，聯合天主教同盟之一的西班牙進攻腓特烈五世所在的普法茲（Pfalz）地區，雙方在布拉格附近的白山交戰，斐迪南二世勝利，腓特烈五世被逼逃亡荷蘭，波希米亞則重新納入神聖羅馬帝國的版圖。波希米亞約有四分之三的地主的土地落入神聖羅馬帝國的地主之手。而神聖羅馬帝國皇帝更強迫波希米亞的百姓改信天主教，並焚毀波希米亞的書籍，宣布德語為波希米亞的官方語言。
斐迪南二世最後雖然拿回波希米亞地區，但其他歐洲國家如法國、英國、荷蘭、丹麥等國因憂心神聖羅馬帝國再度強大，於是接連出兵反制神聖羅馬帝國，帝國也不甘示弱回擊，戰爭一直持續到1648年，交戰各方簽訂《西發里亞和約》（Peace of Westphalia），這場持續30年的宗教戰爭才真正落幕。
30年戰爭結束了自中世紀以來「一個教皇、一個皇帝」統治歐洲的局面，德意志地區作為主戰場，幾乎被破壞殆盡，戰後更分裂為近300個獨立的領地，陷入封建分裂的時代。歐洲權力分配也大洗牌，神聖羅馬帝國嚴重衰弱，西班牙失去一等強國地位，而戰勝國法國得到大量領土，成為歐洲霸主。荷蘭與瑞士則在此時獨立。
